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small28新蟲 (著名寫手)
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[交流]
配體處理方法 已有1人參與
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請問一下,如果做auto dock vina對接,配體該如何處理,看到有文獻(xiàn)用DS軟件直接prepare處理,也有在ADT里加氫,加電荷,設(shè)置旋轉(zhuǎn)鍵的,兩種方法都分別試過,打分不一樣,如果配體是短肽,自己畫的,該用哪種比較靠譜呢,如果用DS,就是加了力場,而ADT里處理沒有加力場的吧 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |


新蟲 (著名寫手)
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但是看了一些教程,沒有進(jìn)行能量優(yōu)化,只對小分子加電荷和設(shè)置鍵的旋轉(zhuǎn),這樣會對結(jié)果有影響么 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

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