 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 793 | 回復(fù): 2 | |||
miaojiu2012新蟲(chóng) (初入文壇)
|
[交流]
基因組保守蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育分析 已有1人參與
|
|
查到文獻(xiàn)中方法是這樣的： 1.從 N個(gè) 基因組中相互檢索所有蛋白質(zhì)（使用 all vs. all BLAST search），根據(jù)檢索得到結(jié)果將蛋白分為不同家族，再進(jìn)行進(jìn)一步的 比較分析，結(jié)合 Blastn(perc identity>75)和 Blastp (evalue=1e-5)，獲得在 N個(gè) 基因組中均保守蛋白。 2.分別對(duì)每個(gè)蛋白運(yùn)用 QuickProbs 2 軟件進(jìn)行比對(duì)，然后運(yùn)用 TrimAl軟件對(duì) 比對(duì)結(jié)果進(jìn)行修剪，移除有太多 gaps 的列，其中 cutoff 值選-gt 0.8。 最后，使用 FastTree的最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。 求問(wèn)下 cutoff 值選-gt 0.8和Blastn(perc identity>75)和 Blastp (evalue=1e-5)是哪里來(lái)的依據(jù)呢？ 謝謝 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
求調(diào)劑，不管什么專(zhuān)業(yè)，我是可塑造的人才一枚，希望遇到知己老師撈撈我
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0703求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿211 化學(xué)305分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085701環(huán)境工程317分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
化學(xué)290求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
298求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
新疆大學(xué)地質(zhì)與礦業(yè)工程學(xué)院招生
已經(jīng)有18人回復(fù)
-
材料325求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
0307化學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
070300化學(xué)求調(diào)劑292分
已經(jīng)有3人回復(fù)
zyz2007
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 10 (幼兒園)
- 金幣: 3523.7
- 紅花: 6
- 帖子: 439
- 在線(xiàn): 438.1小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 445761
- 注冊(cè): 2007-10-28
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 環(huán)境微生物學(xué)
2樓2020-01-27 21:29:11
miaojiu2012
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 33.8
- 帖子: 4
- 在線(xiàn): 1.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2144944
- 注冊(cè): 2012-11-24
- 專(zhuān)業(yè): 環(huán)境微生物學(xué)
3樓2020-01-29 15:53:43
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 miaojiu2012 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 070300化學(xué)求調(diào)劑292分 +3 | 打烊eee 2026-03-07 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿211 085600 280數(shù)二英二求調(diào)劑 +3 | 月山斜 2026-03-06 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 26申博自薦 +7 | 烷基八氮- 2026-03-06 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +7 | 倘若起風(fēng)了呢 2026-03-05 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 哈爾濱理工大學(xué)2026年研究生調(diào)劑，材料科學(xué)與化學(xué)工程學(xué)院研究生調(diào)劑 +3 | xinliu866 2026-03-06 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 280分 +13 | yyqqhh 2026-03-03 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 【求調(diào)劑】293分環(huán)境工程求調(diào)劑材料/化工，服從調(diào)劑，抗壓能力強(qiáng)！ +8 | xiiiia 2026-03-04 | 8/400 |
|
|
[考研] 274環(huán)境工程求調(diào)劑 +6 | 扶柳盈江 2026-03-05 | 6/300 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)]
 本子寫(xiě)完了，給DS兄弟看了，得了92分
+6
|
Doma 2026-03-01 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +3 | 曼殊2266 2026-03-04 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 22408-273求調(diào)劑-擔(dān)任3個(gè)項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人-1篇國(guó)際期刊論文（一作）1篇核心期刊論文在投。 +3 | 沒(méi)想好取什么名 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑院校 +6 | 云朵452 2026-03-02 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 成績(jī)276，專(zhuān)業(yè)代碼0856求調(diào)劑 +10 | 小陳朵 2026-03-03 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 復(fù)試調(diào)劑 +4 | 杰尼龜aaa 2026-03-03 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑一志愿中海洋 +3 | lour. 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 江蘇省農(nóng)科院招調(diào)劑1名 +5 | Qwertyuop 2026-03-01 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
材料270求調(diào)劑
 6+6
|
Eiiiio 2026-03-01 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +3 | 滿(mǎn)天星11_22 2026-03-02 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0854復(fù)試調(diào)劑 276 +5 | wmm9 2026-03-01 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0856化工專(zhuān)碩求調(diào)劑 +15 | 董boxing 2026-03-01 | 15/750 |
|