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[求助]
RCA滾環(huán)擴增中用到的酶的問題 已有1人參與
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| 我看到都是用phi29這種酶來做滾還擴增，用KF聚合酶可以做嗎，以及這兩種酶之間有什么區(qū)別？有做過的前輩可以分享一下嗎。 |
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送紅花一朵 5樓2019-10-11 14:50:32
Tiriosh
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【答案】應助回帖
感謝參與，應助指數(shù) +1
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除了一般的DNA聚合外，RCA最大的特點是需要聚合酶持續(xù)的把之前生成的雙開“頂開”，也就是說需要具有strand displacement性能。根據(jù)NEB官網(wǎng)信息，KF是Moderate strand displacement activity，感覺應該可以做RCA但是可能效率會有影響。與之相對，phi29是strong strand displacement activity。 做RCA用的酶，除了strand displacement性能之外還會考慮exonuclease activity性能，是否具備這一性能對于RCA的實驗細節(jié)有影響。KF不具備外切酶活性（以NEB官網(wǎng)說明為準，來源不同話可能性能有所不同）那么對primer的處理就需要保證其3'端是結核在circular tempalte上，通常的做法是用外切酶trim一下，這也要看你的實驗設計咯。 此外，phi29的一個很大的問題是其最適溫度是30°，所以反應速度會慢一些。如果你是處于提高反應溫度考慮而換酶的話，推薦你使用EquiPhi29，是phi29的熱穩(wěn)定版。 |
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2樓2019-10-08 20:48:04
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3樓2019-10-09 09:08:34
Tiriosh
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4樓2019-10-09 14:53:14
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