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zmcwangyang鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[求助]
做分子對接的蛋白結構如何選擇？ 已有2人參與
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| 新人求助，做分子對接時，在PDB數(shù)據(jù)庫中搜索蛋白，遇到同一個蛋白具有多個結構的情況，比如NR5A2具有1YOK、1YUC、3PLZ等多種結構，該選擇哪個結構來進行分子對接，選擇的理由是什么？求助各位大神，謝謝 |
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4樓2019-12-31 11:41:38
【答案】應助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
zmcwangyang: 金幣+3, ★有幫助 2019-08-16 15:57:53
感謝參與，應助指數(shù) +1
zmcwangyang: 金幣+3, ★有幫助 2019-08-16 15:57:53
| 需要先了解這些所解析的晶體結構是否已經(jīng)包含了擬對接分子的潛在結合位點，還需注意晶體結構中蛋白序列是否為野生型、是否含有PTM、是否存在有可能引起構象變化的特殊有機溶劑和別構效應分子等。如果系列晶體結構的性質都類似，選擇分辨率最高的。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
zmcwangyang2樓2019-08-15 08:08:38
zmcwangyang
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應助: 0 (幼兒園)
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- 注冊: 2019-05-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 臨床藥理
3樓2019-08-15 17:02:36
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