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lyq123456新蟲 (正式寫手)
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[求助]
人的IgG CDR3區(qū)pcr引物設(shè)計(jì)求教 已有1人參與
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第一次接觸抗體引物設(shè)計(jì),不會(huì)設(shè)計(jì),求教大神指點(diǎn)。怎么設(shè)計(jì)IgG的CDR3區(qū)域引物?去哪里能找到恒定區(qū)FR1和FR4的序列?求大神指點(diǎn),感謝。! @wizardfan 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
新蟲 (正式寫手)
鐵桿木蟲 (著名寫手)

新蟲 (正式寫手)
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CDR3的種類變化不是最多嗎,如果想對(duì)BCR測(cè)序的話是不是只需要擴(kuò)一下CDR3的序列就可以?如果針對(duì)CDR3設(shè)計(jì)引物,應(yīng)該設(shè)計(jì)在FR3和FR4兩側(cè)是嗎?另外,想請(qǐng)問可以直接利用IMGT數(shù)據(jù)庫找到引物還是可以像NCBI一樣通過序列自己設(shè)計(jì)引物?沒有找到IMGT數(shù)據(jù)庫的簡單易懂的教程,不是很熟悉這個(gè),能麻煩說的詳細(xì)一些嗎?萬分感謝。。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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如果是bcr測(cè)序從文獻(xiàn)找引物更多,race方法做,反向引物從c區(qū)設(shè)計(jì),擴(kuò)增的文庫用miseq或hiseq測(cè),只關(guān)注cdr3,就不用測(cè)通了。imgt可以找c區(qū)序列自己設(shè)計(jì)引物,文獻(xiàn)里找更快吧,而且肯定都可以用。很多東西都可以做bcr測(cè)序,包括擴(kuò)增和分析的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

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