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lyq123456新蟲 (正式寫手)
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[求助]
人的IgG CDR3區(qū)pcr引物設(shè)計(jì)求教 已有1人參與
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第一次接觸抗體引物設(shè)計(jì)，不會(huì)設(shè)計(jì)，求教大神指點(diǎn)。怎么設(shè)計(jì)IgG的CDR3區(qū)域引物？去哪里能找到恒定區(qū)FR1和FR4的序列？求大神指點(diǎn)，感謝�。。� @wizardfan 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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7樓2019-08-21 09:08:38
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2樓2019-08-13 17:16:19
lyq123456
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CDR3的種類變化不是最多嗎，如果想對(duì)BCR測(cè)序的話是不是只需要擴(kuò)一下CDR3的序列就可以？如果針對(duì)CDR3設(shè)計(jì)引物，應(yīng)該設(shè)計(jì)在FR3和FR4兩側(cè)是嗎？另外，想請(qǐng)問可以直接利用IMGT數(shù)據(jù)庫找到引物還是可以像NCBI一樣通過序列自己設(shè)計(jì)引物？沒有找到IMGT數(shù)據(jù)庫的簡(jiǎn)單易懂的教程，不是很熟悉這個(gè)，能麻煩說的詳細(xì)一些嗎？萬分感謝�。�！ 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
3樓2019-08-14 15:26:11
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西門吹雪170: 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2019-08-21 21:47:47
西門吹雪170: 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2019-08-21 21:47:47
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如果是bcr測(cè)序從文獻(xiàn)找引物更多，race方法做，反向引物從c區(qū)設(shè)計(jì)，擴(kuò)增的文庫用miseq或hiseq測(cè)，只關(guān)注cdr3，就不用測(cè)通了。imgt可以找c區(qū)序列自己設(shè)計(jì)引物，文獻(xiàn)里找更快吧，而且肯定都可以用。很多東西都可以做bcr測(cè)序，包括擴(kuò)增和分析的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2019-08-14 17:50:27
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