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流浪貓小琪銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[交流]
如何使用CBS-QB3尋找過(guò)渡態(tài)
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| 已在其他水平下找到了過(guò)渡態(tài)，打算在此基礎(chǔ)上使用CBS-QB3水平下通過(guò)IRCmax尋找過(guò)渡態(tài)，不知道如何寫(xiě)輸入文件。想請(qǐng)教一個(gè)CBS-QB3做IRCmax的輸入文件。 |
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paramecium86
版主 (著名寫(xiě)手)
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流浪貓小琪(金幣+2): 謝謝參與
流浪貓小琪(金幣+2): 謝謝參與
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這個(gè)沒(méi)法一步完成。 一般來(lái)說(shuō)IRCMax寫(xiě)法如下： IRCMax(方法2:方法1) 含義是是在方法1的IRC途徑上 用方法2在每一個(gè)點(diǎn)都做單點(diǎn)能計(jì)算，找出其中能量最高的點(diǎn)。 但是CBS-QB3是一個(gè)多步驟的方法 其中還包含了第一步一個(gè)opt步驟 所以這個(gè)不能直接寫(xiě)的。 高斯說(shuō)明書(shū)的原話也是這樣說(shuō)的 ： Analytic gradients are required for the IRC portion of the calculation (model1 above). Any non-compound energy method and basis set may be used for model2. CBS-QB3就是屬于 compound energy method。 所以沒(méi)法直接寫(xiě)。如果需要就只能分步驟人工計(jì)算 第一步 先用 方法1 算IRC ， 第二步 自己提取IRC上每一個(gè)點(diǎn)的結(jié)構(gòu) 逐一用CBS-QB3做一次單點(diǎn)能 （如果是Gaussian16 就支持CBS(NoOpt）能自動(dòng)跳過(guò)其中的opt步驟 ，給出能量）。但是G09不支持這個(gè)寫(xiě)法，那么就要人工來(lái)做整個(gè)CBS步驟 人為跳過(guò)opt步驟。 CBS-QB3除去優(yōu)化的話需要進(jìn)行四步驟 1. #p B3LYP/CBSB7 Freq 2. #p CCSD(T)/6-31+G(d') 3. #p Geom=AllCheck Guess=Read MP4SDQ/CBSB4 4. #P Geom=AllCheck Guess=Read MP2/CBSB3 CBSExtrap=(NMin=10,MinPop) 你可以把這四部分的計(jì)算都用--link1--來(lái)隔開(kāi) 寫(xiě)在同一個(gè)文件里。 http://www.chem.ucla.edu/~mccarren/CBSQB3_worksheet/ 這個(gè)網(wǎng)站可以幫你按照CBS-qb3的公式分別取這幾個(gè)計(jì)算中有用的部分加加減減 得到最后的能量。 然后對(duì)每一個(gè)點(diǎn)都要做一次這些運(yùn)算。整個(gè)運(yùn)算步驟還是挺多的。 |
流浪貓小琪7樓2019-05-15 14:27:13
流浪貓小琪
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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- 帖子: 549
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- 蟲(chóng)號(hào): 4568499
13樓2019-05-16 11:42:51
簡(jiǎn)單回復(fù)
rocisky73樓
2019-05-15 12:08
回復(fù)
2019-05-15 12:18
回復(fù)
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