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Western blotting之樣品制備
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無(wú)論你是處理細(xì)胞還是組織樣本,蛋白提取都是一個(gè)很艱難的過(guò)程。要么使用物理方法將細(xì)胞破碎或者使用化學(xué)試劑處理細(xì)胞進(jìn)行裂解。如果第一步提取就搞砸的話,那么長(zhǎng)時(shí)間小心翼翼培養(yǎng)的細(xì)胞就會(huì)完全浪費(fèi)。這里有一些建議可以幫助你進(jìn)行樣品的抽提。 頭號(hào)公敵:蛋白酶 無(wú)論您選擇哪種提取方法,蛋白酶都將是一個(gè)主要的關(guān)注點(diǎn)。當(dāng)你需要的時(shí)候,蛋白酶是很有用的,但是如果你不需要,它們會(huì)在短時(shí)間內(nèi)降解目標(biāo)蛋白。在細(xì)胞被胰蛋白酶消化后,在裂解前徹底清洗去除所有的胰蛋白酶。同樣的道理也適用于組織,在溶解前要徹底清洗,以清除殘留的血液,其中也含有蛋白酶。清洗之后細(xì)胞是干凈的,準(zhǔn)備裂解,要添加蛋白酶抑制劑到裂解緩沖液中。使用蛋白酶抑制劑,并保持樣本在冰上,以防止蛋白降解。如果研究的是磷酸化蛋白,也可以添加磷酸酶抑制劑。 物理vs.化學(xué)方法破碎細(xì)胞 物理裂解方法包括超聲、均質(zhì)、反復(fù)凍融和機(jī)械破碎(研磨、切碎和碾壓)。當(dāng)不想把化學(xué)和酶引入到提取系統(tǒng)中,物理裂解是理想的。然而,專業(yè)設(shè)備的要求往往會(huì)使過(guò)程不一致,難以擴(kuò)大規(guī)模,成本過(guò)高。由于物理方法有關(guān)的壓力和溫度很高,因此還必須小心避免蛋白變性和聚集。在整個(gè)過(guò)程中,把所有的東西都預(yù)先冷卻,并保持樣品的低溫狀態(tài)。 如果您無(wú)法使用物理方法裂解細(xì)胞,請(qǐng)不要擔(dān)心。有很多抽提試劑可以幫助提取蛋白。試劑裂解法因其操作簡(jiǎn)便、蛋白提取量高、穩(wěn)定性好、價(jià)格低廉等優(yōu)點(diǎn)而日益受到人們的歡迎。試劑裂解法的主要缺點(diǎn)是一些鹽和去垢劑等干擾下游分析。如果進(jìn)行蛋白功能研究,在選擇緩沖液和去垢劑時(shí)需要謹(jǐn)慎。 去垢劑的選擇 如果抽提的樣品量大,添加SDS和其他離子去垢劑到你的緩沖液將是你最好的選擇。對(duì)于Western blotting,使用含有SDS的緩沖液是理想的,例如1X RIPA,因?yàn)樗谌芙饧?xì)胞蛋白方面非常有效。如果蛋白需要在其天然構(gòu)象中正常發(fā)揮作用,最好使用溫和的提取方法,使用非離子去垢劑,如NP-40或Triton X-100。 濃度測(cè)定:最后,使用Bradford、BCA或Lowry進(jìn)行蛋白的測(cè)定,進(jìn)行蛋白的等量上樣。 |
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