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starrywang新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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求助，計(jì)算鍵能是否需要對(duì)碎片進(jìn)行構(gòu)型優(yōu)化？
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計(jì)算一個(gè)二聚體分子，想看看鍵能。文獻(xiàn)中表示：鍵能=單體1+單體2-二聚體，其中單體為斷鍵后分裂成的兩個(gè)碎片。 我的問(wèn)題是，是否需要對(duì)兩個(gè)碎片進(jìn)行幾何構(gòu)型優(yōu)化后再分析能量變化，還是可以直接計(jì)算與二聚體中原結(jié)構(gòu)一致的兩個(gè)碎片分別的能量。 因?yàn)閱误w優(yōu)化后變化比較大，有的情況甚至?xí)䲠噫I。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
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paramecium86
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starrywang: 金幣+10, 解決了疑惑 2019-04-22 18:09:03
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文獻(xiàn)中使用的這種衡量鍵能的方法是計(jì)算鍵的解離能（焓），BDE方法。 對(duì)dimmer和兩個(gè)monomer分別進(jìn)行優(yōu)化和頻率計(jì)算 之后 用 H(mono1)+H(mono2)-H（dimmer）得到的就是通常意義上的 BDE，鍵的解離焓。 這個(gè)值也是可以和實(shí)驗(yàn)得到的鍵解離能對(duì)應(yīng)上的。但是鍵的解離能不完全等同于“鍵能”。 這是因?yàn)锽DE會(huì)包含鍵解離后兩個(gè)片段結(jié)構(gòu)發(fā)生變化的穩(wěn)定能。也就是類(lèi)似你說(shuō)的這種情況。 純理論計(jì)算的話上可以不優(yōu)化兩個(gè)monomer 直接用單點(diǎn)能來(lái)計(jì)算 也就是 E（mono1）+E(mono2)-E(dimmer) 來(lái)得到鍵能。但這樣的結(jié)果一般和實(shí)驗(yàn)值對(duì)不上。 |
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starrywang2樓2019-04-22 07:39:48
starrywang
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3樓2019-04-22 18:08:49
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