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starrywang新蟲 (正式寫手)
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[交流]
求助，計算鍵能是否需要對碎片進行構(gòu)型優(yōu)化？
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計算一個二聚體分子，想看看鍵能。文獻中表示：鍵能=單體1+單體2-二聚體，其中單體為斷鍵后分裂成的兩個碎片。 我的問題是，是否需要對兩個碎片進行幾何構(gòu)型優(yōu)化后再分析能量變化，還是可以直接計算與二聚體中原結(jié)構(gòu)一致的兩個碎片分別的能量。 因為單體優(yōu)化后變化比較大，有的情況甚至會斷鍵。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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starrywang: 金幣+10, 解決了疑惑 2019-04-22 18:09:03
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文獻中使用的這種衡量鍵能的方法是計算鍵的解離能（焓），BDE方法。 對dimmer和兩個monomer分別進行優(yōu)化和頻率計算 之后 用 H(mono1)+H(mono2)-H（dimmer）得到的就是通常意義上的 BDE，鍵的解離焓。 這個值也是可以和實驗得到的鍵解離能對應上的。但是鍵的解離能不完全等同于“鍵能”。 這是因為BDE會包含鍵解離后兩個片段結(jié)構(gòu)發(fā)生變化的穩(wěn)定能。也就是類似你說的這種情況。 純理論計算的話上可以不優(yōu)化兩個monomer 直接用單點能來計算 也就是 E（mono1）+E(mono2)-E(dimmer) 來得到鍵能。但這樣的結(jié)果一般和實驗值對不上。 |
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starrywang2樓2019-04-22 07:39:48
starrywang
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3樓2019-04-22 18:08:49
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