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vasp無(wú)報(bào)錯(cuò)信息，但一直沒(méi)辦法運(yùn)行 已有2人參與
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VASP進(jìn)行CeO2晶格優(yōu)化，運(yùn)行后OUTCAR無(wú)報(bào)錯(cuò)信息，但是也無(wú)能量輸出，CONTCAR和OSZICAR也無(wú)數(shù)據(jù)，輸入qstat查看任務(wù)狀態(tài)時(shí)也是一直卡在35秒左右，過(guò)一段時(shí)間就自動(dòng)終止了。附上各參數(shù)設(shè)置與pbs腳本�。。� SYSTEM=CeO2 ISTART=0 ICHARG=2 PREC=Normal LREAL=.FALSE. IBRION=2 ISIF=3 NSW=100 POTIM=0.5 EDIFFG=-0.05 ENCUT=400 ALGO=Fast ISPIN=2 VOSKOWN=1 NCORE=4 NELM=100 EDIFF=0.1E-04 LWAVE=.FALSE. LCHARG=.FALSE. ISMEAR=0 SIGMA=0.2 LDAU=.TURE. LDAUTYPE=2 LDAUL=-1 3 LDAUU=0 5.5 LDAUJ=0 0.5 LMAXMIX=6 ++++++++++++++++ Automatic mesh 0 G 5 5 5 0 0 0 ++++++++++++++++ CeO2 1.0 0.0000000000 2.7030000500 2.7030000000 2.7030000000 0.0000000500 2.7030000000 2.7030000500 2.7030000000 0.0000000000 O Ce 2 1 Direct 0.250000000 0.250000000 0.250000000 0.750000000 0.750000000 0.750000000 0.000000000 0.000000000 0.000000000 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ PBS腳本部分 #!/bin/bash #PBS -N vasp #PBS -l nodes=1:ppn=36 #PBS -q gentai cd $PBS_O_WORKDIR NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE` mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_std #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_ncl #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_gam #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_std #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_ncl #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_gam #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_std #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_ncl #mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_gam |
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2樓2019-03-31 22:07:01
jmlv
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悟空pillart3樓2019-04-01 11:26:38
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好像沒(méi)有out文件產(chǎn)生，不太懂那個(gè)怎么看，我把所有的輸出文件已經(jīng)打包了，如果方便的話麻煩您看一下。 |
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2019-04-01 11:31:26, 135.84 K
4樓2019-04-01 11:42:47
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對(duì)，提交任務(wù)后立馬輸入top都沒(méi)見(jiàn)vasp在運(yùn)行，然后輸入qstat一直卡在35秒左右，我將所有輸出文件打包了，麻煩您給看一下。 |
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2019-04-01 11:44:47, 135.84 K
5樓2019-04-01 11:44:50
6樓2019-04-01 11:49:03
wangxuefei11
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7樓2019-04-01 17:19:06
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8樓2019-04-08 10:57:31
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【答案】應(yīng)助回帖
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悟空pillart: 金幣+100, ★★★★★最佳答案, 好的，非常感謝，應(yīng)該是我節(jié)點(diǎn)的問(wèn)題，我回去再試一下。 2019-04-08 13:55:01
悟空pillart: 金幣+100, ★★★★★最佳答案, 好的，非常感謝，應(yīng)該是我節(jié)點(diǎn)的問(wèn)題，我回去再試一下。 2019-04-08 13:55:01
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你提供的輸入文件，我運(yùn)行過(guò)了，正常結(jié)束。輸出文件，請(qǐng)見(jiàn)附件。 看來(lái)不是輸入文件的問(wèn)題，貌似是你的節(jié)點(diǎn)在你使用的時(shí)候有一點(diǎn)小問(wèn)題。 |
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2019-04-08 13:49:16, 690 K
9樓2019-04-08 13:49:41
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