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VASP進(jìn)行CeO2晶格優(yōu)化，運行后OUTCAR無報錯信息，但是也無能量輸出，CONTCAR和OSZICAR也無數(shù)據(jù)，輸入qstat查看任務(wù)狀態(tài)時也是一直卡在35秒左右，過一段時間就自動終止了。附上各參數(shù)設(shè)置與pbs腳本！��！
SYSTEM=CeO2
ISTART=0
ICHARG=2
PREC=Normal
LREAL=.FALSE.
IBRION=2
ISIF=3
NSW=100
POTIM=0.5
EDIFFG=-0.05
ENCUT=400
ALGO=Fast
ISPIN=2
VOSKOWN=1
NCORE=4
NELM=100
EDIFF=0.1E-04
LWAVE=.FALSE.
LCHARG=.FALSE.
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
LDAU=.TURE.
LDAUTYPE=2
LDAUL=-1 3
LDAUU=0 5.5
LDAUJ=0 0.5
LMAXMIX=6
++++++++++++++++
Automatic mesh
0
G
5 5 5
0 0 0
++++++++++++++++
CeO2
1.0
      0.0000000000       2.7030000500       2.7030000000
      2.7030000000       0.0000000500       2.7030000000
      2.7030000500       2.7030000000       0.0000000000
O Ce
2 1
Direct
   0.250000000       0.250000000       0.250000000
   0.750000000       0.750000000       0.750000000
   0.000000000       0.000000000       0.000000000
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
PBS腳本部分
#!/bin/bash
#PBS -N vasp
#PBS -l nodes=1:ppn=36
#PBS -q gentai
cd $PBS_O_WORKDIR
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_gam

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1樓 2019-03-31 22:01:17

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運行的編號.out和.err有什么提示，有35秒證明算了，應(yīng)該在.out文件里有說明

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2樓2019-03-31 22:07:01

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

我估計，作業(yè)壓根就沒開始算。OUTCAR包含哪些內(nèi)容？

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3樓2019-04-01 11:26:38

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引用回帖:

2樓: Originally posted by Bachelor. at 2019-03-31 22:07:01
運行的編號.out和.err有什么提示，有35秒證明算了，應(yīng)該在.out文件里有說明

好像沒有out文件產(chǎn)生，不太懂那個怎么看，我把所有的輸出文件已經(jīng)打包了，如果方便的話麻煩您看一下。

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附件 1 : vasp.rar

2019-04-01 11:31:26, 135.84 K

4樓2019-04-01 11:42:47

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3樓: Originally posted by jmlv at 2019-04-01 11:26:38
我估計，作業(yè)壓根就沒開始算。OUTCAR包含哪些內(nèi)容？

對，提交任務(wù)后立馬輸入top都沒見vasp在運行，然后輸入qstat一直卡在35秒左右，我將所有輸出文件打包了，麻煩您給看一下。

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2019-04-01 11:44:47, 135.84 K

5樓2019-04-01 11:44:50

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引用回帖:

3樓: Originally posted by jmlv at 2019-04-01 11:26:38
我估計，作業(yè)壓根就沒開始算。OUTCAR包含哪些內(nèi)容？

OUTCAR里面最下面也沒有輸出free energy TOTEN和energy without entropy。

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6樓2019-04-01 11:49:03

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

直接用命令跑看看能不能跑起來，如果軟件啥的沒問題，那估計就你腳本哪有問題，實在不行發(fā)tv遠(yuǎn)程幫你檢查下，這種狀態(tài)基本上就是腳本有問題

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7樓2019-04-01 17:19:06

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【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

6樓: Originally posted by 悟空pillart at 2019-04-01 11:49:03
OUTCAR里面最下面也沒有輸出free energy TOTEN和energy without entropy。...

好的，我跑跑這個作業(yè)看看。

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8樓2019-04-08 10:57:31

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引用回帖:

6樓: Originally posted by 悟空pillart at 2019-04-01 11:49:03
OUTCAR里面最下面也沒有輸出free energy TOTEN和energy without entropy。...

你提供的輸入文件，我運行過了，正常結(jié)束。輸出文件，請見附件。
看來不是輸入文件的問題，貌似是你的節(jié)點在你使用的時候有一點小問題。

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9樓2019-04-08 13:49:41

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