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[求助]
高斯掃描 已有1人參與
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| 用高斯做scan，設(shè)置了兩個掃描變量，都是鍵長，為什么掃描結(jié)果只有一個鍵長改變，另一個一直保持不變呢，希望各位大佬幫忙解答下 |
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paramecium86
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2樓2019-02-28 17:34:33
3樓2019-03-03 14:38:40
paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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小紅豆: 金幣+20, 感謝交流 2019-03-04 08:16:10
小紅豆: 金幣+20, 感謝交流 2019-03-04 08:16:10
| 從輸入文件可以看出這是一個雙變量各掃描10個值的柔性掃描。當(dāng)做雙變量柔性掃描的時候，高斯計算的順序是 先讓第二個變量取第1個值 保持不變 然后改變第一個變量的值從第1個算到第10個。然后再取第二個變量第2個值保持不變 再依次計算第一個變量的所有的值。依次循環(huán) 直到第二個變量所有值都被計算過。 目前這個輸出文件中 只有第一個變量改變 而第二個變量一直沒變的原因就是 還沒計算到第二個變量的第2個值 這個計算就出錯停止了。這個分子大 柔性掃描不好算 尤其是算到最遠(yuǎn)離初始結(jié)構(gòu)的點的時候很容易出問題。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
lu5894樓2019-03-03 22:53:43
5樓2019-03-04 07:58:04
paramecium86
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小紅豆: 金幣+10, 回帖獎勵 2019-03-10 08:00:38
小紅豆: 金幣+10, 回帖獎勵 2019-03-10 08:00:38
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如果那三個部分的分子骨架整體變化不大的話 可以試試剛性掃描 也就是用scan命令。不過這時候你就得用內(nèi)坐標(biāo)來寫分子結(jié)構(gòu)而不能用Cartesian坐標(biāo)系了。如果想用gaussian自動生成zmatrix的話 那最好是把涉及到掃描的那三個原子的序號挨在一起 要不沒法生成想要掃描的變量。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
6樓2019-03-04 08:31:28
7樓2019-03-04 10:56:25
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