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qPCR過表達(dá)成功為何western跑不出flag? 已有1人參與
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已有表達(dá)某白血病融合基因A的測序成功的質(zhì)粒(MSCV-A-flag-IRES-GFP),包病毒后感染正常小鼠骨髓細(xì)胞系,感染后48hGFP陽性率不高在15%左右,分選GFP陽性細(xì)胞到80%左右的陽性率后拿混合克隆進(jìn)行了qPCR和western驗(yàn)證。qPCR用融合基因A的引物能正常擴(kuò)增,且相對表達(dá)量比空載組高3000倍,PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳也能看到明顯過表達(dá)的條帶。由于沒有該融合基因A的直接抗體,因此用flag抗體跑western,過表達(dá)組只有1次能見到非常弱的flag條帶。 然而最想不通的問題在這里—— 上面的混合克隆用流式分選單克隆后養(yǎng)了2周(此時(shí)GFP陽性率接近100%)再做qPCR和western,qPCR過表達(dá)了一萬多倍(顯然比混合克隆高很多),但是western跑了七八次(同樣的flag抗體)就是未見過表達(dá)組有flag條帶。此外,我想要研究的蛋白B,在單克隆組(隨機(jī)取了4組單克隆)和混合克隆組的表達(dá)結(jié)果也接近相反(混合克隆中過表達(dá)融合基因A組顯著高表達(dá)B,而單克隆中過表達(dá)組的B表達(dá)量反而低一些;?qū)用婧苊黠@,蛋白層面不太明顯)。 求助大家。! 1)為何基因?qū)用孢^表達(dá)明顯但蛋白層面幾乎看不出過表達(dá)?flag標(biāo)簽蛋白會丟失嗎? 2)目的基因B在單克隆和混合克隆中的表達(dá)情況不一致,應(yīng)該以哪個(gè)結(jié)果為準(zhǔn)? 如有想法請告知!新手實(shí)驗(yàn)小白缺乏經(jīng)驗(yàn),請大家?guī)兔!謝謝大家。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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