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jjssfan新蟲 (小有名氣)
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[求助]
gaussium氣相怎么設(shè)置和沒有對稱限制怎么輸入 已有1人參與
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我想請問下gaussium計算，文章里面 Geometry optimizations were performed in the gas phase at the M06–2X/6–31 G(d,p) level30, without any symmetry restrictions. 我再route section 部分輸入# opt M062X/6-31G(d,p) geom=connectivity 針對氣相和沒有對稱限制，我需要輸入其他內(nèi)容嗎  |
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匿名 
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3樓2019-03-16 23:00:57
paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
jjssfan: 金幣+5, ★★★很有幫助 2019-02-21 11:41:36
zhou2009: 金幣+8 2019-02-21 17:55:04
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zhou2009: 金幣+8 2019-02-21 17:55:04
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route section里不需要加什么了。 氣相本身不需要加什么keyword。這里所謂氣相的意思就是 計算單個分子 并且不進行溶劑化的計算。 算熱力學(xué)常數(shù)的話 1atm 298.15k是默認(rèn)的。 至于對稱性 那也不需要再route行里做什么。但是需要在input文件里給出初始的分子坐標(biāo)的時候注意一下。 高斯09在Opt過程中不傾向于破壞初始的對稱性。所以如果一開始分子的初始結(jié)構(gòu)是具有對稱性的， 那優(yōu)化完的結(jié)構(gòu)也會傾向于還具有這種對稱性，即使它不是最低能量的結(jié)構(gòu)。（因為有時候具有高對稱性的結(jié)構(gòu)可能只是一個local minimum 而不是global minimum）。高斯在做優(yōu)化的時候 第一步就會根據(jù)input文件里的分子坐標(biāo)判斷對稱性 然后根據(jù)這種對稱性在進行后續(xù)計算。如果不想約束對稱性 穩(wěn)妥的做法是 在畫初始結(jié)構(gòu)的時候不要畫成具有高對稱性的結(jié)構(gòu) 也就是讓優(yōu)化一開始從C1結(jié)構(gòu)開始這樣就能避免優(yōu)化不到最低能量的結(jié)構(gòu)的情形。 |
2樓2019-02-21 02:42:49
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