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jjssfan新蟲(chóng) (小有名氣)
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gaussium氣相怎么設(shè)置和沒(méi)有對(duì)稱限制怎么輸入 已有1人參與
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我想請(qǐng)問(wèn)下gaussium計(jì)算，文章里面 Geometry optimizations were performed in the gas phase at the M06–2X/6–31 G(d,p) level30, without any symmetry restrictions. 我再route section 部分輸入# opt M062X/6-31G(d,p) geom=connectivity 針對(duì)氣相和沒(méi)有對(duì)稱限制，我需要輸入其他內(nèi)容嗎  |
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paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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zhou2009: 金幣+8 2019-02-21 17:55:04
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route section里不需要加什么了。 氣相本身不需要加什么keyword。這里所謂氣相的意思就是 計(jì)算單個(gè)分子 并且不進(jìn)行溶劑化的計(jì)算。 算熱力學(xué)常數(shù)的話 1atm 298.15k是默認(rèn)的。 至于對(duì)稱性 那也不需要再route行里做什么。但是需要在input文件里給出初始的分子坐標(biāo)的時(shí)候注意一下。 高斯09在Opt過(guò)程中不傾向于破壞初始的對(duì)稱性。所以如果一開(kāi)始分子的初始結(jié)構(gòu)是具有對(duì)稱性的， 那優(yōu)化完的結(jié)構(gòu)也會(huì)傾向于還具有這種對(duì)稱性，即使它不是最低能量的結(jié)構(gòu)。（因?yàn)橛袝r(shí)候具有高對(duì)稱性的結(jié)構(gòu)可能只是一個(gè)local minimum 而不是global minimum）。高斯在做優(yōu)化的時(shí)候 第一步就會(huì)根據(jù)input文件里的分子坐標(biāo)判斷對(duì)稱性 然后根據(jù)這種對(duì)稱性在進(jìn)行后續(xù)計(jì)算。如果不想約束對(duì)稱性 穩(wěn)妥的做法是 在畫初始結(jié)構(gòu)的時(shí)候不要畫成具有高對(duì)稱性的結(jié)構(gòu) 也就是讓優(yōu)化一開(kāi)始從C1結(jié)構(gòu)開(kāi)始這樣就能避免優(yōu)化不到最低能量的結(jié)構(gòu)的情形。 |
2樓2019-02-21 02:42:49
匿名 
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3樓2019-03-16 23:00:57
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