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[求助]
硫酸鹽還原菌種群測定 已有1人參與
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本人對微生物不是很了解，有個問題想請教各位大神幫幫忙 。本人實驗將污水廠剩余污泥接種至硫酸鹽還原菌專屬培養(yǎng)液中進行培養(yǎng)，用丙酸鈉作為碳源。培養(yǎng)液配方為：無水硫酸鈉0.5g/L、氯化銨1.0g/L、氯化鈣0.1g/L、磷酸氫二鉀0.5g/L、七水合硫酸鎂2.0g/L、丙酸鈉3.5g/L、酵母浸膏1.0g/L、硫酸亞鐵銨0.5g/L、抗壞血酸0.5g/L，調(diào)pH至7.0，厭氧30～37℃靜置培養(yǎng)。目前硫酸鹽還原效率感覺可以了，想測定其中微生物的種群分布.因為沒有滅菌處理，我覺得其中除了硫酸鹽還原菌，應(yīng)該還會有其他一些微生物,所以想用細菌的16s rRNA通用引物測種群分布，我查了一些文獻，都是用乙酸鈉，乳酸鈉，蔗糖等作為碳源，檢測區(qū)間使用V1-V3，V4，V4-V5，全區(qū)間的都有，我找文獻好慢  不知道使用丙酸鈉作為碳源，檢測哪個區(qū)間會更好，或者有沒有其他更好的辦法。請教懂得大神啊，救救我這種小白吧！感激不盡 |
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選分區(qū)和碳源沒關(guān)系，你可以選最近發(fā)表文章常用的分區(qū)就行，每次保持一致的分區(qū)就可以了。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2019-01-08 06:56:02
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要看你自己的實驗?zāi)康�，如果是僅僅想看其中的微生物種類，那就用通用引物擴增看看種類。如果是已經(jīng)富集過的，富集的都是硫酸還原菌，用通用引物測定沒有問題的。如果使用功能基因測的話，有可能因為注釋的問題，導(dǎo)致物種種類不準確，因為功能基因畢竟不是用于物種分類的生物標記。 |
4樓2019-02-02 15:28:48
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