 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
小木蟲論壇-學(xué)術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » 力場文件修改
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2973 | 回復(fù): 9 | ||
| 【懸賞金幣】回答本帖問題，作者名字太長了將贈送您 5 個金幣 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
[求助]
力場文件修改 已有3人參與
|
||
|
sorption中文獻(xiàn)讓金屬用dreiding，其他uff， 是在uff基礎(chǔ)上，修改金屬原子力場嘛 還有的金屬用的uff其他dreiding這樣子的要看哪一個，金屬到底用的uff還是dreiding 力場文件修改有修改步驟嘛或者一些案例教學(xué)之類的 @smutao 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿天津大學(xué)材料與化工275求調(diào)劑
已經(jīng)有22人回復(fù)
-
0703求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0857 資源與環(huán)境 285分
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料工程,326分，求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
301求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
334求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料與化工085600調(diào)劑求老師收留
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿華科071000生物學(xué) 338求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
290求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
308求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
zyyttty
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 49.8
- 帖子: 42
- 在線: 6.9小時
- 蟲號: 29834985
- 注冊: 2022-07-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 金屬功能材料
8樓2022-11-14 09:30:50
2樓2022-03-13 13:36:37
zyyttty
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 49.8
- 帖子: 42
- 在線: 6.9小時
- 蟲號: 29834985
- 注冊: 2022-07-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 金屬功能材料
【答案】應(yīng)助回帖
| mof-74中的金屬原子用uff力場，而配體骨架結(jié)構(gòu)用dreding力場，而吸附的氣體分子通常用trappe力場，sorption做混合力場需要編輯一下。首先需要將MOF.xsd以car結(jié)構(gòu)導(dǎo)出，得到MOF.car和MOF.mdf均用寫字板打開，在MOF.car文件中將倒數(shù)第三列改為自己想要的符號，如C_R。注意字符不能太多(<4個），否則力場文件中將無法識別，同時設(shè)置MOF.mdf文件。保存后重新導(dǎo)入MS，通過右鍵/Label/Forcefield Type查看設(shè)置的力場類型是否正確；然后，用寫字板打開一個力場文件，將上述設(shè)置的力場類型寫入到ATOMTYPES中，最后，在DIAGONAL_VDW部分按照已有參數(shù)的格式加入新力場類型的兩種力場參數(shù)σ和ε，單位分別為Å和kcal/mol，力場文件編輯完畢 |
3樓2022-11-08 20:24:10
4樓2022-11-09 12:14:47
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 291分獸醫(yī)專碩 一志愿華中農(nóng) +3 | 種大大太陽 2026-03-05 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿浙江大學(xué)0856材料與化工求調(diào)劑 +3 | yansheng@211 2026-03-09 | 4/200 |
|
|
[考研] 081200計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)數(shù)一英一306求調(diào)劑 +3 | intankt 2026-03-08 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑，一志愿陜師大生物學(xué) +3 | ??????.?.??? 2026-03-09 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 282分材料專業(yè)求調(diào)劑院校 +16 | 楓橋ZL 2026-03-09 | 23/1150 |
|
|
|
[考研] 313分生物學(xué)求調(diào)劑 +5 | Yyt楊1 2026-03-09 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3 | 三dd. 2026-03-10 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856材料與化工309分求調(diào)劑 +4 | ZyZy…… 2026-03-10 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料專碩調(diào)劑 +7 | 慕辰123 2026-03-05 | 10/500 |
|
|
|
[考博] 求材料讀博院校 +9 | yanglei131 2026-03-08 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 0817化學(xué)工程319求調(diào)劑 +7 | lv945 2026-03-08 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 材料與化工 一志愿山大 321分 求調(diào)劑 +6 | 每天散步 2026-03-09 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0703求調(diào)劑 +10 | c297914 2026-03-06 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，數(shù)一英一274分 +4 | 小菲會努力 2026-03-08 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 理學(xué)287分求調(diào)劑 +4 | 看看我. 2026-03-05 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +11 | 朝天椒的雙馬尾 2026-03-05 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 材料化工求調(diào)劑 +7 | 博斯特525 2026-03-06 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | 52hz~~ 2026-03-05 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 呼呼？~+123456 2026-03-06 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研282分求調(diào)劑，接受跨專業(yè) +4 | 劉淄博 2026-03-04 | 7/350 |
|