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qianqiuxue5683木蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何模擬分子自組裝結(jié)果？
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一個(gè)具有特定結(jié)構(gòu)的分子，比如是萘環(huán)，把這樣的分子放入特定溶劑中，隨著溫度降低，分子在溶劑中會(huì)有一些自組裝行為，比如溶解度下降-析出結(jié)晶等等。或者一個(gè)分子的熔融狀態(tài)，隨著溫度降低，分子會(huì)自發(fā)組裝成晶體或無定形體。類似這樣的自組裝行為（主要是相變）用什么軟件能夠模擬呢？希望大家指導(dǎo)。謝謝。 |
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用介觀方法，比如DPD，還有就是沒那么簡(jiǎn)單就能出結(jié)果，你看文獻(xiàn)可能覺得沒啥，那也是人家花了很多精力搞出來的啊 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://m.gaoyang168.com/3g ] |
6樓2019-07-02 21:31:10
qianqiuxue5683
木蟲 (正式寫手)
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3樓2019-07-01 13:27:36
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4樓2019-07-02 10:21:31
qianqiuxue5683
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送紅花一朵 |
謝謝回復(fù)。我試過MS中的幾個(gè)模塊，不是很理想。Amorphous Cell下建的盒子，在其中放入分子，無論如何也得不到自組裝成的晶體結(jié)構(gòu)，這個(gè)模塊好像就是為無定形結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)的；Polymorph模塊下建的盒子（其實(shí)是個(gè)單胞），得到的總是晶體結(jié)構(gòu)，其實(shí)這個(gè)模塊就是預(yù)測(cè)晶體結(jié)構(gòu)的，不算自組裝。難道是用Forcite模塊嗎？用Amorphous Cell建好無定形盒子后，用Forcite跑了幾次，感覺不算是真正的自組裝，結(jié)構(gòu)很亂。也許是我的參數(shù)設(shè)置不合理。再試試。多謝多謝。 |
5樓2019-07-02 20:13:05
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