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| 【懸賞金幣】回答本帖問題，作者木有昵稱我將贈送您 5 個金幣 | |||
木有昵稱我新蟲 (初入文壇)
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[求助]
請問用AutoDock Vina做金屬配合物的分子對接怎么做 已有1人參與
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各位大佬，請問： （1）AutoDock Vina 做金屬配合物分子對接怎么做 （2）我利用的是晶體的CIF文件進(jìn)行對接，金屬離子是Cu，怎么給金屬修正電荷呢？ （3）如果是自己繪制金屬配合物的結(jié)構(gòu)，該怎樣對金屬部分進(jìn)行操作呢？ @smutao 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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【答案】應(yīng)助回帖
| 不知道您的問題解決了沒有，最近我也在做這方面的東西，有一種解決方法是在生成的.pdbqt找到Cu，手動添加電荷。可以參考這篇文章，是以格列衛(wèi)為例進(jìn)行分子對接的，我感覺很棒：https://www.nature.com/articles/nprot.2016.051 |
2樓2022-10-09 17:40:36
3樓2025-09-22 22:49:43
薛定諤軟件
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
4樓2025-10-18 00:20:46
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