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| 【懸賞金幣】回答本帖問題,作者迪妮莎的淚將贈送您 50 個金幣 | ||
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關(guān)于FISH的一些疑問
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我方向是環(huán)境工程偏微生物(厭氧氨氧化),需要觀察反應(yīng)器內(nèi)活的厭氧氨氧化細菌隨時間數(shù)量的變化?次墨I的描述,測定的方法是測MLVSS結(jié)合live/dead實驗以及FISH實驗,我的問題是: 1)FISH實驗中,能夠與探針原位雜交的細菌只是活的嘛,還是死的活的都能與探針雜交?原理是為什么 2)FISH實驗中為何需要用多聚甲醛等物質(zhì)對細菌進行固定這一步驟?固定是指固定細菌的移動還是形狀還是其它?不固定后果是什么? 望大神解答感激不盡! 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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先回答(2),F(xiàn)ISH的固定步驟主要是為了穩(wěn)定大分子和細胞骨架結(jié)構(gòu),避免雜交的過程中細胞裂解。參考如下https://www.arb-silva.de/fish-pr ... =General%20overview,of%20the%20cells%20during%20hybridization. 這個過程基本上對細胞會造成很大影響,固定完細胞也差不多死了。 對于你提到的(1),我不清楚你指的是想只針對采樣中的活細胞進行檢測呢?還是說需要在檢測中操持細胞活性? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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非常感謝您的回答,對于1)我的意思是FISH中用到的探針,比如專門與大腸桿菌染色體雜交的探針,能夠與初始狀態(tài)的樣品中死的大腸桿菌雜交嗎,還是只能夠與初始狀態(tài)的樣品中活的大腸桿菌雜交。我問這個問題是因為,我需要測定一個成分不單一(有多種細菌包含在內(nèi))的污泥中的其中一種細菌的活細菌數(shù)量隨時間變化,而在看到的文獻中為了測量這一種細菌的活菌數(shù)量,是用總的MLVSS(表示所有種類,活的死的細菌總的數(shù)量),乘以LIVE/DEAD值(表示所有細菌中活細菌的比例,但不區(qū)分細菌種類),再乘以FISH值(即用兩種探針,一種是能夠與所有細菌種類雜交的探針,另一種是只能夠與目的種類的細菌雜交的特異性探針,即能夠得到該目的細菌占所有細菌數(shù)量的比例),我不懂的就是,按照這種方法如果是正確的,那么FISH過程中是不是只有樣品中原本活著的細菌才能夠與探針雜交,樣品中已經(jīng)死的細菌,是不是細菌的染色體成分在死后很快就分解了(我不太了解細菌死亡后的生理過程),因此通過FISH雜交也檢測不出來 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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