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小木蟲于

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[交流] vasp 6.4.3 運行出錯 LAPACK: Routine ZPOTRF failed! kpoint: 1 spin: 1

今天編譯了vasp6.4.3, epyc 9654 cpu，ubuntu 24.04 server系統(tǒng)。編譯好后，一運行就出現(xiàn)這個錯誤：
Orbital orthonormalization failed in the inversion of matrix |
| LAPACK: Routine ZPOTRF failed! kpoint: 1 spin: 1

不知道是否有人遇到這個問題，怎么解決的？不吝賜教，非常感謝

信息：結(jié)構(gòu)沒有任何問題，用vasp 5.4 運行一切正常，vasp6.4.3就不行

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1樓 2025-11-14 20:36:10

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9樓2025-11-15 23:35:25

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是vasp6.4.3有bug么？

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14樓2025-11-16 22:27:27

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試了vasp6.5.0，還是不行，手里沒有6,5,1的安裝包。時不是用aocc aocl openmpi編譯有問題啊

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15樓2025-11-17 08:11:01

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EPYC 9654 是 Zen4，大部分人遇到這個錯誤都是因為：

1. 鏈接到系統(tǒng)自帶的 OpenBLAS/BLIS → 數(shù)值不穩(wěn)定

Ubuntu 24.04 默認 LAPACK/OpenBLAS 非常不適合 VASP 6（尤其是大量 BLAS3 操作）。

解決：避免使用系統(tǒng) OpenBLAS，強烈建議使用 Intel oneMKL。
尤其是 -ffast-math 會讓 Hermitian 矩陣出現(xiàn)非正定情況，ZPOTRF 就會炸。

檢查你的 makefile.include 是否包含：
-Ofast
-ffast-math
-funsafe-math-optimizations

如果存在，全部改成：

-O2 -march=native

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17樓2025-11-17 12:18:05

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17樓: Originally posted by rlafite at 2025-11-17 12:18:05
EPYC 9654 是 Zen4，大部分人遇到這個錯誤都是因為：

1. 鏈接到系統(tǒng)自帶的 OpenBLAS/BLIS → 數(shù)值不穩(wěn)定

Ubuntu 24.04 默認 LAPACK/OpenBLAS 非常不適合 VASP 6（尤其是大量 BLAS3 操作）。

解決：避免使用 ...

我是用spack安裝的aocc和aocl，vasp的makefile.include 里面是直接連接到了spack安裝的。makefile.include如下：
# Default precompiler options
CPP_OPTIONS = -DHOST=\"LinuxGNU\" \
            -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \
            -DscaLAPACK \
            -DCACHE_SIZE=4000 \
            -Davoidalloc \
            -Dvasp6 \
            -Duse_bse_te \
            -Dtbdyn \
            -Dfock_dblbuf

CPP       = flang -E -ffree-form -C -w $*$(FUFFIX) >$*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)

FC       = mpif90
FCL       = mpif90

FREE       = -ffree-form -ffree-line-length-none
FFLAGS    = -w -fno-fortran-main -Mbackslash

OFLAG    = -O2
OFLAG_IN = $(OFLAG)
DEBUG    = -O0

OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o
OBJECTS_O1 += fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o

# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB    = $(CPP)
FC_LIB    = $(FC)
CC_LIB    = clang
CFLAGS_LIB  = -O
FFLAGS_LIB  = -O1
FREE_LIB = $(FREE)

OBJECTS_LIB = linpack_double.o

# For the parser library
CXX_PARS = clang++
LLIBS    = -lstdc++

##
## Customize as of this point! Of course you may change the preceding
## part of this file as well if you like, but it should rarely be
## necessary ...

# relevant target when cross-compiling for another architecture
VASP_TARGET_CPU ?= -march=native
FFLAGS    += $(VASP_TARGET_CPU)

# BLAS (mandatory)
AMDBLIS_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdblis-5.0-hi5do7p2j5yk3xxo5eaff76d57ozinlr
BLAS       = -L${AMDBLIS_ROOT}/lib -lblis

# LAPACK (mandatory)
AMDLIBFLAME_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdlibflame-5.0-72mkvewha6igrfhobf7uceemuy3xu4dp
LAPACK    = -L${AMDLIBFLAME_ROOT}/lib -lflame

# scaLAPACK (mandatory)
AMDSCALAPACK_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdscalapack-5.0-2ok2w3vt4dpnmouvy5ezfksheypcxg3b
SCALAPACK = -L${AMDSCALAPACK_ROOT}/lib -lscalapack

LLIBS    += $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)

# FFTW (mandatory)
AMDFFTW_ROOT  ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/amdfftw-5.0-fuzt5flfdtrmytkknf6dgpcomzpnbpiq
LLIBS    += -L$(AMDFFTW_ROOT)/lib -lfftw3
INCS    += -I$(AMDFFTW_ROOT)/include

# HDF5-support (optional but strongly recommended)
#CPP_OPTIONS+= -DVASP_HDF5
#HDF5_ROOT  ?= /path/to/your/hdf5/installation
#LLIBS    += -L$(HDF5_ROOT)/lib -lhdf5_fortran
#INCS    += -I$(HDF5_ROOT)/include

# For the VASP-2-Wannier90 interface (optional)
CPP_OPTIONS += -DVASP2WANNIER90
WANNIER90_ROOT ?= /public/spack/opt/spack/linux-zen4/wannier90-3.1.0-qvmhejtugcrv7cz4xenk2y235lld2hrw
LLIBS       += -L$(WANNIER90_ROOT)/lib -lwannier

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18樓2025-11-17 14:39:58

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非常感謝，已經(jīng)搞定了，用spack安裝的庫不行，后來重新單獨安裝了aocl就可以了。應該是spack安裝aocl的時候優(yōu)化的過頭了。

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19樓2025-11-17 15:23:41

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Hewei

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21樓2025-11-18 14:28:59

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hs0218

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23樓2025-12-05 15:59:17

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