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畢合生物2024銅蟲 (小有名氣)
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這個“胖瘦不一”的曲線圖，能讓你秒懂?dāng)?shù)據(jù)分布
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小提琴圖是一種結(jié)合了箱線圖和密度圖優(yōu)點(diǎn)的數(shù)據(jù)統(tǒng)計圖，因其形狀酷似小提琴而得名。 1 小提琴圖有什么用？ 我們用一個通俗的例子說明。假如有2個班級：A班和B班，這兩個班的某一次考試的平均分都是75分，那是不是說明大家都考75分左右？是不是說明這兩個班級的學(xué)生情況都差不多？不一定。 當(dāng)你只需要知道“平均是多少”時，那看平均值或中位數(shù)就行。但如果你想知道“這個平均值是如何產(chǎn)生的，是大部分人都在平均線附近？還是學(xué)霸和學(xué)渣對半分導(dǎo)致了平均值”？那么你就需要看小提琴圖。 2 小提琴圖怎么看？ 那具體怎么解讀一張小提琴圖呢？這個圖主要由兩個部分構(gòu)成：外部的密度圖以及內(nèi)部的箱線圖。 密度圖（Density Plot） 這是小提琴圖最具特色的部分，也就是上圖所示的左右對稱的黃色區(qū)域。它反映的是數(shù)據(jù)在不同數(shù)值上的分布密度。圖形越寬的地方，表示在這個數(shù)值范圍內(nèi)的數(shù)據(jù)越多，越窄，說明該區(qū)域的數(shù)據(jù)越少。 箱線圖（Box Plot） 在琴身，也就是密度圖的內(nèi)部，有一個類似“箱子”的矩形區(qū)域，這就是箱線圖。它能提供關(guān)鍵的統(tǒng)計信息，幫助我們快速判斷數(shù)據(jù)的集中趨勢和離散程度。 箱線圖包含以下元素： 1. 中位數(shù)：白色圓點(diǎn)，代表數(shù)據(jù)的中間值。表示有一半數(shù)據(jù)比它大，一半比它小。 2. 第一四分位數(shù)（Q1）：箱子的下邊界，表示有25%的數(shù)據(jù)低于這個值。 3. 第三四分位數(shù)（Q3）：箱子的上邊界，表示有75%的數(shù)據(jù)低于這個值。 4. 四分位距（IQR）：IQR=Q₃-Q₁，也就是箱子的高度。矩形區(qū)域越長，說明中間 50% 的數(shù)據(jù)越分散，反之則說明越集中。 5. 最小值和最大值：分別對應(yīng)數(shù)據(jù)的最低值和最高值。 3 什么時候會用到小提琴圖？ 小提琴圖經(jīng)常會出現(xiàn)在單細(xì)胞RNA測序（scRNA-seq）這類前沿研究中。 研究者們可以將數(shù)萬個細(xì)胞分成不同的類型（比如免疫細(xì)胞、神經(jīng)細(xì)胞等），然后利用小提琴圖來比較某個關(guān)鍵基因在這些不同細(xì)胞類型中的表達(dá)量有何不同。 每一把“小提琴”代表一種細(xì)胞類型，“琴身”的形狀能直觀地反映該基因在這種細(xì)胞類型中的表達(dá)量分布。 如果我們發(fā)現(xiàn)某把“小提琴”的上半部分很寬，下半部分很窄，那就說明大部分這種類型的細(xì)胞中的該基因表達(dá)量都很高。反之，若圖形底部寬、頂部窄，則表明表達(dá)量普遍偏低。 如果“琴身”中間凹陷，甚至呈現(xiàn)雙峰或多峰，則意味著這種類型的細(xì)胞內(nèi)部可能存在異質(zhì)性——比如可進(jìn)一步細(xì)分為高表達(dá)和低表達(dá)兩個亞群，可能對應(yīng)不同的功能狀態(tài)或分化階段。 畢合生物(www.bihebio.com)提供服務(wù)內(nèi)容：分子生物學(xué)、免疫, 重組蛋白及ELISA相關(guān)、活性小分子化合物、高端化學(xué)、材料化學(xué)、細(xì)胞資源庫與培養(yǎng)相關(guān)、生命科學(xué)、天然產(chǎn)物 |
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