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無學(xué)論hh新蟲 (初入文壇)
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[求助]
節(jié)桿菌和假節(jié)桿菌分離 已有1人參與
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有沒有大神,能幫忙解答一下我的問題,我的菌在合肥這邊測序測16srRNA無雙峰顯示純菌,NCBI比對后是節(jié)桿菌,然后我就想著測細(xì)菌基因組草圖找目的基因,把樣品送去了生工,但是生工那邊一直說有污染,送了三次,每次都顯示是節(jié)桿菌和假節(jié)桿菌這兩個屬,現(xiàn)在卡在這里進(jìn)行不下去,有人遇到這種情況嗎,或者有解決方法嗎?跪謝! 發(fā)自小木蟲手機(jī)客戶端 |
新蟲 (初入文壇)
送紅花一朵 |
謝謝大佬,我這邊已經(jīng)分離純化3次了,在合肥這邊公司鑒定純后,送去生工的時候還是不行,選擇培養(yǎng)基倒是還沒有試過。我今天查文獻(xiàn)說假節(jié)桿菌屬是2016年從節(jié)桿菌屬中分類出來的,合肥測序發(fā)過來的16rs基因序列去NCBi庫中比對也會出現(xiàn)幾個假節(jié)桿菌序列 發(fā)自小木蟲手機(jī)客戶端 |
金蟲 (正式寫手)
| 建議嘗試用選擇性培養(yǎng)基(如添加特定抗生素或調(diào)整碳氮源)或劃線分離法多次純化單菌落,再挑取單菌落重新提取 DNA 測序,大概率能解決節(jié)桿菌與假節(jié)桿菌的混合污染問題。 |
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