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科研戰(zhàn)神來(lái)了新蟲 (小有名氣)
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WB實(shí)驗(yàn)常見內(nèi)參抗體
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在蛋白質(zhì)印跡(Western boltting,WB)實(shí)驗(yàn)中,內(nèi)參抗體是檢測(cè)內(nèi)參蛋白的核心工具。不同內(nèi)參抗體對(duì)應(yīng)不同的內(nèi)參蛋白,其表達(dá)部位、分子量、適用樣本類型存在顯著差異,選對(duì)抗體直接影響WB結(jié)果的準(zhǔn)確性。今天我們主要針對(duì)實(shí)驗(yàn)中最常用的幾類內(nèi)參抗體,從核心特性、適用場(chǎng)景到選擇注意事項(xiàng)進(jìn)行全面解析。主要包括β-actin抗體、GAPDH抗體、β-tubulin抗體、Histone H3抗體、ATP1A1抗體、VDAC1抗體等。 01β-actin抗體β-actin是構(gòu)成細(xì)胞骨架的重要蛋白,在幾乎所有真核細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中穩(wěn)定表達(dá)亞細(xì)胞定位:主要分布于細(xì)胞質(zhì)中。分子量:約42 kDa適用情況:β-actin在 WB 實(shí)驗(yàn)中,可用于常規(guī)細(xì)胞質(zhì)蛋白檢測(cè)以校正上樣量,適配細(xì)胞裂解液、組織勻漿等多種樣本,普通實(shí)驗(yàn)條件下條帶清晰、無(wú)需特殊優(yōu)化。慎用情況:①若目標(biāo)蛋白位于細(xì)胞核(如組蛋白)、細(xì)胞膜(如受體蛋白)或線粒體,β-actin的細(xì)胞質(zhì)分布特性使其無(wú)法精準(zhǔn)校正上樣量,易誤判結(jié)果。②脂肪組織的主要結(jié)構(gòu)成分是大量脂滴,細(xì)胞質(zhì)被擠壓得極少,而 β-actin主要分布于細(xì)胞質(zhì)——這種細(xì)胞結(jié)構(gòu)特殊性會(huì)導(dǎo)致脂肪組織中 β-actin的實(shí)際表達(dá)量較低且可能不穩(wěn)定,因此脂肪細(xì)胞慎用 02甘油醛-3-磷酸脫氫酶抗體甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)是糖酵解途徑的關(guān)鍵酶,在細(xì)胞能量代謝中起核心作用,其表達(dá)量在多數(shù)細(xì)胞和組織中穩(wěn)定。亞細(xì)胞定位:主要存在于細(xì)胞質(zhì)中。分子量:約36 kDa適用情況:目標(biāo)蛋白分子量接近42 kDa時(shí),用β-actin抗體會(huì)導(dǎo)致條帶重疊,此時(shí)選擇GAPDH抗體,可清晰區(qū)分內(nèi)參條帶與目標(biāo)蛋白條帶;不過(guò)也可以直接剝離后孵育,所以這點(diǎn)不是特別的重要;糖代謝相關(guān)實(shí)驗(yàn):研究糖酵解、胰島素信號(hào)通路等與能量代謝相關(guān)的實(shí)驗(yàn)時(shí),GAPDH的表達(dá)更能反映細(xì)胞 “基礎(chǔ)代謝狀態(tài)”;部分 “β-actin不穩(wěn)定” 的樣本如在脂肪細(xì)胞中,β-actin表達(dá)可能較低,而GAPDH表達(dá)更穩(wěn)定,此時(shí)用 GAPDH抗體作為內(nèi)參更合適。慎用情況:在細(xì)胞缺氧、以及糖尿病模型中一般不用GAPDH。 03β-微管蛋白抗體β-微管蛋白(β-tubulin)是構(gòu)成細(xì)胞微管的主要成分,參與細(xì)胞分裂、物質(zhì)運(yùn)輸?shù)冗^(guò)程,其表達(dá)量在多數(shù)細(xì)胞中穩(wěn)定亞細(xì)胞定位:細(xì)胞質(zhì)分子量:約55 kDa適用情況:用于細(xì)胞質(zhì)蛋白的檢測(cè);細(xì)胞骨架相關(guān)實(shí)驗(yàn):研究微管組裝、細(xì)胞遷移、細(xì)胞極性等與細(xì)胞骨架相關(guān)的實(shí)驗(yàn)時(shí),β-tubulin的表達(dá)更貼合實(shí)驗(yàn)背景,作為內(nèi)參更合理;慎用情況:神經(jīng)細(xì)胞中β-tubulin表達(dá)較高不適用;非細(xì)胞質(zhì)目標(biāo)蛋白檢測(cè)。 04組蛋白H3抗體當(dāng)檢測(cè)細(xì)胞核內(nèi)的目標(biāo)蛋白(如轉(zhuǎn)錄因子、組蛋白修飾酶、染色質(zhì)相關(guān)蛋白)時(shí),細(xì)胞質(zhì)內(nèi)參抗體(β-actin、GAPDH)不再適用 , 因?yàn)榧?xì)胞核提取物中,細(xì)胞質(zhì)蛋白含量極低,內(nèi)參條帶會(huì)很弱,無(wú)法校正上樣量。此時(shí),組蛋白H3抗體是 “細(xì)胞核內(nèi)參的首選”。亞細(xì)胞定位:細(xì)胞核分子量:約15~17 kDa適用情況:細(xì)胞核蛋白提取實(shí)驗(yàn):如提取細(xì)胞核提取物,檢測(cè) NF-κB、p53 等轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)時(shí);細(xì)胞周期相關(guān)實(shí)驗(yàn):研究細(xì)胞增殖、分裂(如 G1/S 期轉(zhuǎn)換、有絲分裂)時(shí),組蛋白 H3 的表達(dá)穩(wěn)定,不受細(xì)胞周期階段影響,作為內(nèi)參更可靠。慎用情況:需要嚴(yán)格區(qū)分 “核蛋白樣本” 與 “全細(xì)胞樣本”:在全細(xì)胞裂解液中,組蛋白H3的含量遠(yuǎn)低于β-actin、GAPDH,內(nèi)參條帶會(huì)很弱,不適合作為全細(xì)胞樣本的內(nèi)參。 05鈉鉀ATP酶α1亞基抗體鈉鉀ATP酶α1亞基(ATP1A1)是細(xì)胞膜上負(fù)責(zé)離子轉(zhuǎn)運(yùn)的關(guān)鍵蛋白,因在細(xì)胞膜上穩(wěn)定表達(dá),常作為 “細(xì)胞膜蛋白檢測(cè)” 的內(nèi)參抗體亞細(xì)胞定位:細(xì)胞膜分子量:約110 kDa適用情況:細(xì)胞膜蛋白檢測(cè)實(shí)驗(yàn);膜蛋白提取純度驗(yàn)證:在提取細(xì)胞膜蛋白的實(shí)驗(yàn)中,若 ATP1A1 條帶清晰,而細(xì)胞質(zhì)內(nèi)參(如 β-actin)、細(xì)胞核內(nèi)參(如組蛋白 H3)條帶微弱,說(shuō)明膜蛋白提取純度高,無(wú)明顯污染。慎用情況:避免用于 “非膜蛋白樣本”:在全細(xì)胞裂解液中,ATP1A1 的含量遠(yuǎn)低于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)參,內(nèi)參條帶會(huì)較暗;若檢測(cè)細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核蛋白,不建議用 ATP1A1 抗體作為內(nèi)參。 06線粒體研究相關(guān)抗體①VDAC1是線粒體外膜上的通道蛋白,負(fù)責(zé)物質(zhì)進(jìn)出線粒體,在幾乎所有真核細(xì)胞的線粒體中穩(wěn)定表達(dá);分子量約31 kDa適用情況:檢測(cè)線粒體外膜蛋白[如線粒體融合蛋白1(MFN1)],或驗(yàn)證線粒體提取是否成功(若VDAC1條帶清晰,說(shuō)明線粒體提取有效)。②COX IV是線粒體呼吸鏈復(fù)合物 IV 的亞基,定位于線粒體內(nèi)膜,參與有氧呼吸,其表達(dá)量與細(xì)胞呼吸活性無(wú)關(guān),在不同細(xì)胞和組織中穩(wěn)定;分子量約17 kDa。 |
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