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科研戰(zhàn)神來了新蟲 (小有名氣)
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實驗解惑|WB實驗常見內(nèi)參抗體一文全解析
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在蛋白質(zhì)印跡(Western boltting,WB)實驗中,內(nèi)參抗體是檢測內(nèi)參蛋白的核心工具。不同內(nèi)參抗體對應不同的內(nèi)參蛋白,其表達部位、分子量、適用樣本類型存在顯著差異,選對抗體直接影響WB結(jié)果的準確性。今天我們主要針對實驗中最常用的幾類內(nèi)參抗體,從核心特性、適用場景到選擇注意事項進行全面解析。主要包括β-actin抗體、GAPDH抗體、β-tubulin抗體、Histone H3抗體、ATP1A1抗體、VDAC1抗體等。 01β-actin抗體β-actin是構(gòu)成細胞骨架的重要蛋白,在幾乎所有真核細胞的細胞質(zhì)中穩(wěn)定表達亞細胞定位:主要分布于細胞質(zhì)中。分子量:約42 kDa適用情況:β-actin在 WB 實驗中,可用于常規(guī)細胞質(zhì)蛋白檢測以校正上樣量,適配細胞裂解液、組織勻漿等多種樣本,普通實驗條件下條帶清晰、無需特殊優(yōu)化。慎用情況:①若目標蛋白位于細胞核(如組蛋白)、細胞膜(如受體蛋白)或線粒體,β-actin的細胞質(zhì)分布特性使其無法精準校正上樣量,易誤判結(jié)果。②脂肪組織的主要結(jié)構(gòu)成分是大量脂滴,細胞質(zhì)被擠壓得極少,而 β-actin主要分布于細胞質(zhì)——這種細胞結(jié)構(gòu)特殊性會導致脂肪組織中 β-actin的實際表達量較低且可能不穩(wěn)定,因此脂肪細胞慎用 02甘油醛-3-磷酸脫氫酶抗體甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)是糖酵解途徑的關(guān)鍵酶,在細胞能量代謝中起核心作用,其表達量在多數(shù)細胞和組織中穩(wěn)定。亞細胞定位:主要存在于細胞質(zhì)中。分子量:約36 kDa適用情況:目標蛋白分子量接近42 kDa時,用β-actin抗體會導致條帶重疊,此時選擇GAPDH抗體,可清晰區(qū)分內(nèi)參條帶與目標蛋白條帶;不過也可以直接剝離后孵育,所以這點不是特別的重要;糖代謝相關(guān)實驗:研究糖酵解、胰島素信號通路等與能量代謝相關(guān)的實驗時,GAPDH的表達更能反映細胞 “基礎(chǔ)代謝狀態(tài)”;部分 “β-actin不穩(wěn)定” 的樣本如在脂肪細胞中,β-actin表達可能較低,而GAPDH表達更穩(wěn)定,此時用 GAPDH抗體作為內(nèi)參更合適。慎用情況:在細胞缺氧、以及糖尿病模型中一般不用GAPDH。 03β-微管蛋白抗體β-微管蛋白(β-tubulin)是構(gòu)成細胞微管的主要成分,參與細胞分裂、物質(zhì)運輸?shù)冗^程,其表達量在多數(shù)細胞中穩(wěn)定亞細胞定位:細胞質(zhì)分子量:約55 kDa適用情況:用于細胞質(zhì)蛋白的檢測;細胞骨架相關(guān)實驗:研究微管組裝、細胞遷移、細胞極性等與細胞骨架相關(guān)的實驗時,β-tubulin的表達更貼合實驗背景,作為內(nèi)參更合理;慎用情況:神經(jīng)細胞中β-tubulin表達較高不適用;非細胞質(zhì)目標蛋白檢測。 04組蛋白H3抗體當檢測細胞核內(nèi)的目標蛋白(如轉(zhuǎn)錄因子、組蛋白修飾酶、染色質(zhì)相關(guān)蛋白)時,細胞質(zhì)內(nèi)參抗體(β-actin、GAPDH)不再適用 , 因為細胞核提取物中,細胞質(zhì)蛋白含量極低,內(nèi)參條帶會很弱,無法校正上樣量。此時,組蛋白H3抗體是 “細胞核內(nèi)參的首選”。亞細胞定位:細胞核分子量:約15~17 kDa適用情況:細胞核蛋白提取實驗:如提取細胞核提取物,檢測 NF-κB、p53 等轉(zhuǎn)錄因子的表達時;細胞周期相關(guān)實驗:研究細胞增殖、分裂(如 G1/S 期轉(zhuǎn)換、有絲分裂)時,組蛋白 H3 的表達穩(wěn)定,不受細胞周期階段影響,作為內(nèi)參更可靠。慎用情況:需要嚴格區(qū)分 “核蛋白樣本” 與 “全細胞樣本”:在全細胞裂解液中,組蛋白H3的含量遠低于β-actin、GAPDH,內(nèi)參條帶會很弱,不適合作為全細胞樣本的內(nèi)參。 05鈉鉀ATP酶α1亞基抗體鈉鉀ATP酶α1亞基(ATP1A1)是細胞膜上負責離子轉(zhuǎn)運的關(guān)鍵蛋白,因在細胞膜上穩(wěn)定表達,常作為 “細胞膜蛋白檢測” 的內(nèi)參抗體亞細胞定位:細胞膜分子量:約110 kDa適用情況:細胞膜蛋白檢測實驗;膜蛋白提取純度驗證:在提取細胞膜蛋白的實驗中,若 ATP1A1 條帶清晰,而細胞質(zhì)內(nèi)參(如 β-actin)、細胞核內(nèi)參(如組蛋白 H3)條帶微弱,說明膜蛋白提取純度高,無明顯污染。慎用情況:避免用于 “非膜蛋白樣本”:在全細胞裂解液中,ATP1A1 的含量遠低于細胞質(zhì)內(nèi)參,內(nèi)參條帶會較暗;若檢測細胞質(zhì)、細胞核蛋白,不建議用 ATP1A1 抗體作為內(nèi)參。 06線粒體研究相關(guān)抗體①VDAC1是線粒體外膜上的通道蛋白,負責物質(zhì)進出線粒體,在幾乎所有真核細胞的線粒體中穩(wěn)定表達;分子量約31 kDa適用情況:檢測線粒體外膜蛋白[如線粒體融合蛋白1(MFN1)],或驗證線粒體提取是否成功(若VDAC1條帶清晰,說明線粒體提取有效)。②COX IV是線粒體呼吸鏈復合物 IV 的亞基,定位于線粒體內(nèi)膜,參與有氧呼吸,其表達量與細胞呼吸活性無關(guān),在不同細胞和組織中穩(wěn)定;分子量約17 kDa。 |
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