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honeyDANDAN鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
thirdorder 摻雜體系如何擴(kuò)胞 已有1人參與
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摻雜體系要保證40個原子摻雜1個原子,原胞是5個原子,計(jì)算時要在ms里先擴(kuò)胞后再在vasp 中計(jì)算,可以實(shí)現(xiàn)1個原子的摻雜濃度 問題?♀?計(jì)算晶格熱導(dǎo)率時,使用有限位移法計(jì)算的時候,可以使用擴(kuò)胞體系進(jìn)行1*1*1的有限位移法計(jì)算嗎? 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
木蟲 (正式寫手)
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在使用有限位移法計(jì)算晶格熱導(dǎo)率時,涉及兩個關(guān)鍵問題: 1. 是否可以使用擴(kuò)胞體系進(jìn)行 1×1×1 的有限位移法計(jì)算? 可以的,但這里的 1×1×1 是指超胞的尺寸,即對擴(kuò)大的超胞進(jìn)行計(jì)算,并非對原始原胞進(jìn)行。 有限位移法需要足夠大的超胞來避免周期性邊界條件下的相互干擾,常見是 3×3×3 的原胞擴(kuò)展。 若你已將原胞擴(kuò)展為 40 原子超胞(滿足摻雜需求),那么對這個超胞進(jìn)行 1×1×1 有限位移計(jì)算是合理的。 即:你用的“1×1×1”指的是不再進(jìn)一步擴(kuò)展這個摻雜后的超胞,直接在它上面施加有限位移,這是可以的。 2. 注意事項(xiàng): 盡管摻雜體系較大,仍需確保位移原子的選擇能代表體系的對稱性和局域擾動。 對于低對稱摻雜體系,Phonopy 這類軟件在生成位移結(jié)構(gòu)時可能會產(chǎn)生大量非等價(jià)位移,需要一定計(jì)算資源。 若使用的是 ShengBTE、Phono3py 等工具來計(jì)算熱導(dǎo)率,建議使用對稱性降得不太多的體系,或考慮無摻雜體系先做基準(zhǔn)。 |
木蟲 (正式寫手)
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你提到的體系要求 40個原子中摻雜1個原子,即摻雜濃度為 2.5%。原胞是 5 個原子,因此: 為滿足摻雜比例,需要構(gòu)造一個包含 40 個原子的超胞。 即在 VASP/MS 中,需要構(gòu)造一個 2×2×2的超胞,使得總原子數(shù)為 40。 在構(gòu)建好 40 原子超胞后,替換其中一個目標(biāo)原子為摻雜元素,即可實(shí)現(xiàn)所需摻雜濃度。 這個步驟應(yīng)在 Materials Studio 或其他結(jié)構(gòu)建模軟件中完成擴(kuò)胞和摻雜操作,再輸出結(jié)構(gòu)給 VASP 計(jì)算 |
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