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VASP計算石墨烯-Ni(111)界面,結構跑散 已有2人參與
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各位蟲友好,最近我在用VASP計算石墨烯-Ni(111)界面的結合能和相互作用。我用了4層Ni金屬層和單層石墨烯,根據(jù)多個文獻中的報道,Ni原子排列在C原子上方和六元環(huán)中間的上方最穩(wěn)定,我按這個構建了超晶胞,并設置了20埃的真空層,這種排列Ni(111)晶格失配度在1.2%。結構優(yōu)化計算中,我固定了石墨烯層中所有的碳原子,并且固定了晶胞參數(shù),只允許所有金屬原子自由弛豫。但是弛豫計算結束后,我期待的是所有金屬原子應該在x-y面上的位置幾乎不變,應該在z軸上弛豫,并且每層金屬層上的Ni原子應該還會保持在同一高度(z坐標一樣),這樣才會和文獻中報道的一樣,才能得到穩(wěn)定的界面距離和界面結構。 但是,當結束結構弛豫計算后,結構似乎“跑散”了,即越是遠離石墨烯的金屬層上的Ni原子不僅會在x-y面上弛豫,并且也會在z方向上弛豫,導致弛豫后Ni原子不在C原子的正上方或六元環(huán)的中心的上方,并且z方向上,同一金屬層的Ni原子也不再同一高度了,越遠離石墨烯的金屬層,這種現(xiàn)象更明顯。這是為什么?怎么才能得到文獻中一樣的效果?我的計算問題出在哪兒? 感謝各位提供寶貴的意見。 |
新蟲 (小有名氣)
木蟲 (正式寫手)
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你的Ni(111)層在遠離石墨烯時“跑散”可能是因為: Ni 原子自由度過高,應固定底部2層Ni,或在x-y方向約束部分Ni原子。VASP 的 Selective Dynamics 選項可以用于固定某些原子的 x-y 方向,保證其只沿 z 方向弛豫。例如,在 POSCAR 里設置: Selective dynamics Direct x1 y1 z1 F F T x2 y2 z2 F F T ... 弛豫參數(shù)(IBRION, POTIM, EDIFFG)需要優(yōu)化,嘗試 IBRION = 2、POTIM = 0.1–0.15、EDIFFG = -0.01。 檢查K點密度和贗勢選擇,以確保精度足夠。試試 EDIFFG = -0.01 或更嚴格的值,看看是否能得到更合理的結構。 |
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感謝你的回答。我是只固定了石墨烯層,允許所有金屬層在三個方向上自由弛豫,結果金屬層上的Ni就會“跑散”,因為我看到文獻中有的文獻報道的是固定單層石墨烯和晶胞參數(shù),允許所有金屬原子弛豫;還有的文獻是使用3+3金屬層slab,固定遠離石墨烯的三層金屬層,讓靠近石墨烯的三層金屬和石墨烯自由弛豫。如果文獻中報道的正確的話,這兩種方法都不應該使結構“跑散”。你說的固定x, y方向,只允許部分Ni原子在z方向弛豫,會不會導致得不到最穩(wěn)定的構型?我理解的是即便不固定金屬Ni原子,它們也應該大概率只會沿著z方向弛豫,因為我搭建的構型,Ni原子的排列方式應該是最穩(wěn)定的構型,所有我期待著不需要多少離子步就該結束計算,因為原始結構已經(jīng)很接近最穩(wěn)定的構型,只是z方向上的距離需要優(yōu)化。 |
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