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小慌不張鐵蟲 (初入文壇)
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求助：請(qǐng)問有人用Gaussian算過金屬卟啉嗎 已有2人參與
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請(qǐng)問有人用Gaussian算過金屬卟啉的能級(jí)嗎，我原本的目的是用ChemDraw畫出金屬卟啉鈀的結(jié)構(gòu)，轉(zhuǎn)成3D結(jié)構(gòu)，然后放到Gaussian里面算能級(jí)，但現(xiàn)在3D結(jié)構(gòu)很奇怪，高斯里面也找不到PdTFPP對(duì)應(yīng)的基組,C、N、H一般使用6-31G 文獻(xiàn)說卟啉環(huán)是平面四吡咯大環(huán)，但是我將ChemDraw素材庫里面的卟啉轉(zhuǎn)換為3D結(jié)構(gòu)后，球棍模型是扭曲的，不在一個(gè)平面。再加入一個(gè)金屬原子，結(jié)構(gòu)更歪七扭八的更奇怪了。 (救命，上傳不了圖片，按交流貼說的用了flash,依然不行）。 |
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小慌不張
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5樓2025-01-15 10:14:32
paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
| 卟啉自己在GV里畫也不是太費(fèi)勁。如果實(shí)在不習(xí)慣用GV 那或者找其他算過包含卟啉的機(jī)理的文章里的SI給弄出來卟啉的結(jié)構(gòu)。都未必是完全一樣的 有個(gè)骨架弄出來改改就業(yè)很簡單。基組當(dāng)然有適配的比如 6-31G* (這個(gè)極化基組一定要加 否則結(jié)果太差） 不要用GV里自帶的。那里面太少。真正用高斯做計(jì)算肯定是自己寫輸入文件和關(guān)鍵詞。并且看高斯的說明書里提到的有什么基組是支持的。不要就看GV里面列出來那區(qū)區(qū)幾個(gè)基組。高斯相關(guān)的教程也是多入牛毛了。查查就有。 |
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2樓2024-12-26 12:28:05
小慌不張
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送紅花一朵 |
你好，謝謝，請(qǐng)問GV是什么軟件呀，沒有搜到，因?yàn)槲也皇撬愀咚沟哪莻�(gè)人，我是畫了PdTFPP的結(jié)構(gòu)給別的同學(xué)算，他說我的結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)成3D不在一個(gè)平面，非常奇怪，但是他也是才學(xué)高斯，也不熟悉 發(fā)自小木蟲手機(jī)客戶端 |
3樓2025-01-10 12:04:22
paramecium86
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4樓2025-01-10 16:51:19
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