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zhiqiang2013新蟲 (初入文壇)
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文獻(xiàn)里的那些圖—熱圖/柱狀圖
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識(shí)圖能力停留在只會(huì)看高中函數(shù)圖象的自己，除了看熱鬧，完全不知道這一幅幅圖代表著什么意思，看不懂圖成了我們讀文獻(xiàn)的第一道坎。有句話說得好，三分文章七分圖，一幅精美的figure在一篇文獻(xiàn)中的地位舉足輕重，所以，想要速讀文獻(xiàn)，抓住重點(diǎn)，就要練就一眼看懂圖的本領(lǐng)。話不多說，圖來(lái)了！ 一、熱圖 初讀文獻(xiàn)時(shí)，大家一定經(jīng)常見到這種熱圖，花花綠綠，很是高大上！但其實(shí)它是數(shù)據(jù)表現(xiàn)的入門必備技術(shù)，相對(duì)也比較簡(jiǎn)單，那它到底有什么用呢？大家先來(lái)看這張表：請(qǐng)?jiān)谌腌妰?nèi)指出表中哪一塊的數(shù)字較大？ 黑人問號(hào)臉？三秒鐘我一行數(shù)據(jù)都看不完！但是如果看下面這張圖，告訴你紅色代表數(shù)字較大，原諒色代表數(shù)字較�。� 大家是不是一眼就可以找到較大的數(shù)字在哪里！沒錯(cuò)，這就是熱圖！熱圖（heatmap）是一個(gè)以顏色變化來(lái)顯示數(shù)據(jù)的矩陣。它的用途主要包括兩大方面：1）直觀展示重點(diǎn)研究對(duì)象的表達(dá)量及數(shù)據(jù)差異變化情況；2）呈現(xiàn)多樣本或多基因表達(dá)量的聚類關(guān)系。其實(shí)天下各圖本一家，和函數(shù)圖像一樣，只要搞懂縱坐標(biāo)，橫坐標(biāo)代表什么，那么這幅圖要表達(dá)的意思也就呼之欲出了。 比如這幅圖，要怎么看呢？我們先把它分成五部分： �、倬褪撬臋M坐標(biāo)，代表樣本； ②是它的縱坐標(biāo)，代表基因，此外還表示紅色代表高表達(dá)，綠色代表低表達(dá)； �、凼撬闹黧w部分，代表各個(gè)基因在樣本中的表達(dá)情況； �、鼙硎具@些樣本共分為了兩類； �、菔菍�(duì)這些基因表達(dá)模式的聚類分析的樹形圖。 所以這幅圖要表達(dá)的意思是這8種基因在兩類樣本中的表達(dá)情況，大家可以直觀的看到天藍(lán)色的樣本某些區(qū)域要比粉紅色樣本更紅一些，也就是這些基因表達(dá)量更高一些。 通過對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行這樣的可視化處理以后，我們就可以很清楚的看到兩類樣本基因表達(dá)含量的差異性，從而幫助我們抓住研究重點(diǎn)，對(duì)差異性進(jìn)行進(jìn)一步的分析。 二、柱狀圖 這里的柱狀圖分為柱狀圖、堆積柱狀圖、浮動(dòng)柱狀圖。在解讀柱狀圖之前，先來(lái)為大家講講其中的一些核心組成部分。誤差棒是在柱狀圖中經(jīng)常出現(xiàn)的，誤差棒就是在統(tǒng)計(jì)圖中表示誤差的線段，此處有三個(gè)概念要向大家介紹，分別是標(biāo)準(zhǔn)差（sd）、標(biāo)準(zhǔn)誤（se）和間接表達(dá)誤差的指標(biāo)置信區(qū)間。標(biāo)準(zhǔn)差實(shí)際上反映的是數(shù)據(jù)點(diǎn)的波動(dòng)情況，標(biāo)準(zhǔn)誤是均值的波動(dòng)情況。而置信區(qū)間（cl）我們最常用的則是95%cl=(均值-1.96se,均值+1.96se)，以下為誤差棒的一些圖像表示： 柱狀圖用于比較不同類別或組別之間的數(shù)據(jù)量或數(shù)據(jù)關(guān)系，它通過繪制垂直或水平的矩形柱來(lái)表示各個(gè)類別的數(shù)據(jù)，柱的高度或長(zhǎng)度表示相應(yīng)數(shù)據(jù)的大小或數(shù)量，典型適用場(chǎng)景如下： 1、數(shù)據(jù)比較：高低大小一目了然； 2、類別分布展示：數(shù)據(jù)的組成或分布特征十分清晰； 3、時(shí)間序列數(shù)據(jù)：可以通過觀察數(shù)據(jù)隨時(shí)間的變化，幫助讀者分析趨勢(shì)、季節(jié)性變化或其他時(shí)間相關(guān)的特征； 4、多維數(shù)據(jù)比較：通過在同一個(gè)柱狀圖中繪制不同類別和變量的柱形，可以同時(shí)比較它們的數(shù)據(jù)量、數(shù)量或頻率，幫助讀者理解不同變量之間的關(guān)系和差異。 其次講到堆積柱狀圖，堆積柱狀圖是一種柱狀圖的變體，通過在同一柱形上堆疊不同類別的矩形柱來(lái)表示數(shù)據(jù)每個(gè)類別的矩形柱在整個(gè)柱形上的高度表示該類別的數(shù)據(jù)量，而各個(gè)類別內(nèi)部的分布通過柱形的分割來(lái)展示，典型適用場(chǎng)景如下： 1、多維數(shù)據(jù)比較：堆積柱狀圖適合用于展示各個(gè)類別內(nèi)部的分布情況。通過堆積的方式，將不同類別的數(shù)據(jù)在同一柱形上進(jìn)行可視化； 2、變化趨勢(shì)分析：通過在不同時(shí)間點(diǎn)或時(shí)間段繪制堆積柱狀圖，可以直觀地觀察類別之間的變化趨勢(shì)和整體分布的變化情況。 浮動(dòng)柱狀圖也是一種柱狀圖的變體，用于顯示具有起始值和終止值的數(shù)據(jù)區(qū)間或時(shí)間段。每個(gè)數(shù)據(jù)區(qū)間由一個(gè)水平的矩形柱表示，起始值和終止值決定了柱形的長(zhǎng)度和位置，典型適用場(chǎng)景有： 1、時(shí)間段比較-浮動(dòng)柱狀圖適合用于比較不同時(shí)間段或時(shí)間段之間的數(shù)據(jù)區(qū)間。通過繪制具有起始值和終止值的柱形，可以直觀地顯示時(shí)間段的持續(xù)時(shí)間和數(shù)據(jù)區(qū)間的差異，幫助讀者理解和比較時(shí)間段內(nèi)的事件、過程或現(xiàn)象； 2、任務(wù)進(jìn)度展示：起始值與終止值表示任務(wù)或項(xiàng)目的開始和結(jié)束時(shí)間，柱形的長(zhǎng)度表示任務(wù)或項(xiàng)目的持續(xù)時(shí)間，讀者可以直觀地了解各個(gè)任務(wù)或項(xiàng)目的進(jìn)度或時(shí)間跨度； 3、資源利用比較：浮動(dòng)柱狀圖可以清晰地展示每個(gè)資源的起始值和終止值，讀者可以對(duì)比資源之間的利用差異和時(shí)間分布。 |
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2024-11-21 15:51:20, 32.63 K
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