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lidigencai新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何檢測引物和目的序列的特異性（或則說是否存在多結(jié)合點(diǎn)）？
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構(gòu)建好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌，長出菌落后挑點(diǎn)送測序，測序引物用的不是通用引物而是需要合成的引物，結(jié)果測序結(jié)果有雙峰現(xiàn)象，和測序公司溝通后最大的可能就是引物有多個(gè)結(jié)合點(diǎn)。我想求助各位大佬，我從目的序列中選擇一段序列作為測序引物的話，使用什么方法/軟件可以檢測我選擇的引物和構(gòu)建的目的質(zhì)粒序列（包含目的序列）是否存在多個(gè)結(jié)合位點(diǎn)？ 注：我在網(wǎng)上尋找過答案，網(wǎng)上關(guān)于檢測引物特異性的信息和我的預(yù)期不符：他們是將序列放到軟件中，然后設(shè)置引物參數(shù)，然后軟件就能在序列上找到符合參數(shù)設(shè)置的引物，但是實(shí)際過程中引物的設(shè)計(jì)很多時(shí)候沒得選，只能在某個(gè)位置的。 |
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