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總獎金10000美元!銅仁市舉辦第一屆分子3D電子云-活性關(guān)系深度學(xué)習(xí)競賽(DECAR-2024)
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https://mp.weixin.qq.com/s/gpktate28aub6gm-rnqvdg https://www.gztrc.edu.cn/info/1024/36051.htm 在人工智能領(lǐng)域飛速發(fā)展的今天,深度學(xué)習(xí)技術(shù)在各個行業(yè)都取得了顯著的成果。為了進(jìn)一步推動深度學(xué)習(xí)技術(shù)在分子3d電子云-活性關(guān)系(decar)研究領(lǐng)域的應(yīng)用,由銅仁學(xué)院和銅仁市科技局組織,將于2024年7月1日啟動舉辦為期16個月的“第一屆分子3d電子云-活性關(guān)系深度學(xué)習(xí)競賽(decar-2024)”。此次競賽旨在匯聚頂尖科研團(tuán)隊(duì),針對理論和應(yīng)用化學(xué)中關(guān)于如何預(yù)測分子的活性這一基礎(chǔ)和重大問題,共同探討深度學(xué)習(xí)技術(shù)在分子結(jié)構(gòu)與活性關(guān)系研究中的創(chuàng)新應(yīng)用,為相關(guān)領(lǐng)域的科研人員提供一個展示成果、交流思想的平臺。 競賽的主題為“深度學(xué)習(xí)與分子3d電子云-活性關(guān)系建模研究”,旨在通過深度學(xué)習(xí)技術(shù),基于精確和嚴(yán)格的理論化學(xué)數(shù)據(jù),探索分子結(jié)構(gòu)與活性關(guān)系之間的內(nèi)在聯(lián)系,為藥物設(shè)計、材料科學(xué)、化學(xué)工程等領(lǐng)域提供新的理論基礎(chǔ)和技術(shù)支持。此次學(xué)術(shù)競賽為線上比賽,分為報名、提交模型、評審和頒獎四個階段,參賽團(tuán)隊(duì)需要提交相關(guān)的模型和預(yù)測結(jié)果,經(jīng)過專家評審,最終選拔出優(yōu)秀的團(tuán)隊(duì)和模型進(jìn)行模型發(fā)布和頒獎。 此次競賽的舉辦,不僅有助于推動深度學(xué)習(xí)技術(shù)在分子3d電子云-活性關(guān)系研究領(lǐng)域的應(yīng)用,還將為銅仁市的科技創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)發(fā)展注入新的活力。 附:比賽章程 第一屆分子3d電子云-活性關(guān)系深度學(xué)習(xí)競賽(decar-2024)章程 sample text 1. 競賽目標(biāo) 為了促進(jìn)分子深度電子云/場-活性關(guān)系(deep electron cloud-activity and field-activity relationships ,decar/dfar)方法的發(fā)展和應(yīng)用,對給出的3d高質(zhì)量電子云大型數(shù)據(jù)集,要求開發(fā)一個3d深度學(xué)習(xí)模型,根據(jù)分子的電子云數(shù)據(jù)預(yù)測其是否具有抗癌活性(二類問題)。 2. 組織方 銅仁學(xué)院, 銅仁市科學(xué)技術(shù)局 3. 數(shù)據(jù)集描述和獲取 本數(shù)據(jù)集中的高質(zhì)量3d電子云數(shù)據(jù)均由嚴(yán)格的量子化學(xué)密度泛函理論(dft)方法計算產(chǎn)生,通過gaussian-16w進(jìn)行分子幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化,計算精度均等于或高于b3lyp/6-311g**水平。訓(xùn)練數(shù)據(jù)集(參賽者可任意劃分驗(yàn)證集)包括了5965個分子(no.00001-05965)的精確3d電子云和二元活性值(活性=1,非活性=0); 預(yù)測集共包含4187個分子的精確3d電子云數(shù)據(jù)(no.06015-10214,其中缺失13個數(shù)據(jù))。電子云數(shù)據(jù)的格式是matlab 3d陣列數(shù)據(jù)(array,文件擴(kuò)展名為.mat),每個數(shù)據(jù)大小為500×500×500,也即每個電子云數(shù)據(jù)包含了125,000,000個數(shù)據(jù)點(diǎn)。所有電子云數(shù)據(jù)未作任何額外處理,如歸一化、中心化等變換。下圖顯示了16個分子的3d電子云數(shù)據(jù)。 圖:16個分子的3d電子云數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)獲取鏈接1: https://pan.baidu.com/s/18ukmad7ukap6c5szgeritq 提取碼: apd7(百度網(wǎng)盤) 數(shù)據(jù)獲取鏈接2:https://pan.baidu.com/s/1mtex5bvqsfvdh2y-bagdka 提取碼: 59ew(百度網(wǎng)盤) 4. 競賽規(guī)則 4.1參賽資格 對學(xué)術(shù)界、工業(yè)界和獨(dú)立研究者開放。 4.2提交要求 參賽者需提交訓(xùn)練好的模型或代碼(如果有的話,含預(yù)處理代碼,用于重現(xiàn)和評價結(jié)果)、訓(xùn)練過程的簡單描述、模型結(jié)構(gòu)描述和模型預(yù)測結(jié)果。限于python和matlab框架。鼓勵參賽者使用但不限于3d卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型。參賽者可使用任意必要的數(shù)據(jù)處理方法,包括但不限于數(shù)據(jù)擴(kuò)增、旋轉(zhuǎn)不變、可變輸入、學(xué)習(xí)增強(qiáng)等操作,以提高學(xué)習(xí)能力、學(xué)習(xí)速度和預(yù)測準(zhǔn)確度。 4.3評價標(biāo)準(zhǔn) 對預(yù)測集中4187個分子電子云數(shù)據(jù)活性值的預(yù)測準(zhǔn)確度(accuracy)是唯一的評價標(biāo)準(zhǔn)。 5. 競賽流程 5.1報名方法 通過郵箱報名:chyxl@gztrc.edu.cn 或 boshenglee@163.com。參賽者在郵件中提交參賽基本信息。包括:姓名(或筆名)、單位(非必須)、郵箱。我們會給每一個參賽者分配一個唯一的參賽id。 5.2報名和比賽開始日期 2024年7月1日。 5.3報名截止日期 2025年8月1日。 5.4模型提交截止日期 2025年10月1日。 5.5結(jié)果公布和頒獎 2025年11月1日。 6. 獎勵 獎金共計10, 000美元,取前8名。1-3名分別獎勵4,000美元,2,500美元和1,500美元;4-8名為優(yōu)秀獎,各獎勵400美元。為所有獲獎?wù)哳C發(fā)獲獎證書。 7. 競賽評委 唐麗娟博士、教授(湖南大學(xué)); 鄒鴻雁博士、副教授(西南大學(xué)); 徐路博士、教授(銅仁學(xué)院); 楊琴博士、副教授(長江大學(xué)); 言思敏高級工程師(上海市質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)技術(shù)研究院) 8. 知識產(chǎn)權(quán) 所有參賽者應(yīng)允許組織方對其參賽的結(jié)果進(jìn)行(匿名)公布,并允許向?qū)W術(shù)界發(fā)布提交的模型(匿名與否將取決于模型完成人)。在引用完成人的前提下,任何人均可將參賽的模型免費(fèi)用于學(xué)術(shù)用途, 其商業(yè)應(yīng)用的權(quán)利則歸完成人所有。 9. 參考文獻(xiàn) [1]lu xu, qin yang. deep electron cloud-activity and field-activity relationships. journal of chemometrics, 2023, 37(8): e3503. doi: 10.1002/cem.3503 [2]lu xu, qin yang. artificial intelligence and big data analysis of electron cloud density. research & reviews: journal of chemistry, 2023, 12: 001. doi: 10.4172/2319-9849.12.2.001 10. 聯(lián)系方式 如有任何問題或疑問,請聯(lián)系chyxl@gztrc.edu.cn 或 boshenglee@163.com。 [ Last edited by boshenglee on 2024-7-21 at 07:53 ] |
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