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best2023新蟲 (初入文壇)
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[求助]
蛋白質(zhì)設計
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alphafold3預測蛋白模型,下載后有5個模型,怎么選擇呀?第一個模型一定是最好的嘛? 分子對接用DS柔性對接出來的結(jié)果和Autodock Vina剛性對接,以及CB-dock2盲對接出來的結(jié)合位點都不一樣,該怎樣取舍呀?需要再用autodouck再試一試柔性對接嘛?或者是diffdock對接?(補充:底物結(jié)合位點關(guān)鍵殘基未知,僅知道結(jié)構(gòu)域) proteinMPNN用網(wǎng)頁版設計后,看結(jié)構(gòu)那里顯示error,,總是報錯,是因為蛋白質(zhì)分子太大了嘛?生成的序列怎樣評價呀? |
新蟲 (小有名氣)
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