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[求助]
基因敲除實(shí)驗(yàn)求助 已有1人參與
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基因敲除實(shí)驗(yàn)求助,本人正在做假單胞菌株基因的敲除,利用同源重組的原理構(gòu)建了上下游同源臂,載體為自殺質(zhì)粒含SacB基因?qū)φ崽敲舾校阎匦聵?gòu)建目的基因上下游至自殺質(zhì)粒中,利用接合轉(zhuǎn)移或是電轉(zhuǎn)方法在雙抗板上篩選出野生菌攜帶重組質(zhì)粒。 目的基因是耐藥基因,野生菌株是假單胞菌(含有4ug/ml美羅抗性,在10ug/ml四環(huán)素也能長,超過20ug/ml四環(huán)素不長),使用的自殺質(zhì)粒是含有SacB基因的pEX18Tc(含有四環(huán)素抗性),在單交換這一步嘗試過接合轉(zhuǎn)移,也嘗試過電轉(zhuǎn),有時(shí)能在雙抗板上長出單克隆,有時(shí)不能;有一次電轉(zhuǎn)后將雙抗板(20ug/ml四環(huán)素+4ug/ml美羅)上的出現(xiàn)單克隆進(jìn)行之字劃線后做PCR,概率是120個中出現(xiàn)了2個SacB陽性條帶和野生株特異基因條帶,將陽性的之字劃線再去密涂保種方便后續(xù)用蔗糖平板篩選出雙交換,但是將密涂保種的菌進(jìn)行PCR時(shí),SacB陽性條帶已經(jīng)消失了,再去取之字上的菌做PCR時(shí),SacB基因陽性條帶也消失了,求助各位大神想知道這是什么原因,為什么出現(xiàn)條帶后又消失了,如果正確的話我應(yīng)該如何將陽性條帶進(jìn)行保種,好不容易出現(xiàn)一次SacB陽性,已經(jīng)很久沒做出這個實(shí)驗(yàn)了,我應(yīng)該如何得到單交換菌株??求助各位大佬們有空時(shí)解答。。 還有一個問題得到單交換菌株后,用無抗性液體培養(yǎng)后稀釋1000倍再涂布蔗糖平板,再利用原始野生株包含目的基因上下游片段進(jìn)行PCR,若敲除成功,則擴(kuò)增條帶將缺少目的基因?qū)?yīng)的長度。嘗試在10%的蔗糖和15%蔗糖平板上涂布了,37℃溫箱培養(yǎng)了18h,再挑取很多個單克隆做的PCR,還是沒結(jié)果,是否蔗糖平板在37℃溫箱培養(yǎng)時(shí)間要延長??求助各位大佬們有空時(shí)解答。。 |

新蟲 (小有名氣)
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