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引用回帖:

9樓: Originally posted by xusuyu98 at 2024-02-08 02:19:33
謝謝。如果我是為了算表面拼接的異質(zhì)結(jié)模型初始架構(gòu)的合理性調(diào)整位置算總能的話，pbe可以用嗎？...

得看你的體系是什么體系，雖然一般體系PBE可以，但涉及到特定的元素或者特定的體系有可能需要DFT+U或者DFT-D/vdW-DF等，當(dāng)然這些修正一個是不那么ab initio，一個是特定場景會出現(xiàn)短板，所以做之前方法的選取應(yīng)該適當(dāng)做測試和調(diào)研文獻。

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11樓2024-02-08 14:39:24

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rlafite

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【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

10樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2024-02-07 18:35:16
也不好說，吸附能其實是一種結(jié)合能，如果對于晶體來說，牽扯到形成能的計算，其實PBE和HSE也會算出差別，甚至模量等信息也會有差別，這點可以參考HSE作者J Heyd的論文。結(jié)構(gòu)方面可能會有一些差別，但可能從測試集來 ...

你忽視計算的目的是什么，你計算的基礎(chǔ)又是什么。

所謂的結(jié)構(gòu)優(yōu)化，大都是基于降低能量，而你計算的方法大量又使用了近似。
如果計算和實驗不符合，難道你對自己的計算還那么有信心嗎？
[so lot of experimentalists suggest to Stay Away from Theorists]

所以我讓樓主比較加與不加的差別

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12樓2024-02-09 00:12:03

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12樓: Originally posted by rlafite at 2024-02-09 00:12:03
你忽視計算的目的是什么，你計算的基礎(chǔ)又是什么。

所謂的結(jié)構(gòu)優(yōu)化，大都是基于降低能量，而你計算的方法大量又使用了近似。
如果計算和實驗不符合，難道你對自己的計算還那么有信心嗎？

所以我讓樓主比較 ...

正因為用了近似，所以計算要和實驗符合到100%那是不可能的，如果你對DFT的特性了解就知道很可能性質(zhì)A算到誤差以內(nèi)（例如實驗偏差的5%）可能性質(zhì)B會誤差開外甚至很多，所以這種信心沒意義，看你想側(cè)重的問題是什么，通過計算到底要解決什么問題（雖然更客觀說很多人只是發(fā)paper）。所以我前面觀點比較明確，即便HSE去算這個能量也未必合理（雖然多個測試表明大概率HSE的結(jié)果會可信一些，但也不能排除個別幾個典型例外的體系），得看要解決的體系是什么何種物理效應(yīng)主導(dǎo)（比如是否是強局域庫倫體系等），綜合選擇一個性價比高的方案。

PBE優(yōu)化HSE算單點一定合理嗎？就以晶體為例，假定按照PBE的極值點和HSE的極值點做泰勒展開，局部的勢能面姑且認(rèn)為是二次型的，那么PBE的極小點一定對應(yīng)HSE極小點嗎？這樣會有額外的誤差嗎？HSE的參數(shù)優(yōu)化是在PBE算出來的結(jié)構(gòu)上嗎？PBE的結(jié)構(gòu)就能確保和實驗值有很好的對應(yīng)嗎？如果我們真的要做一個嚴(yán)謹(jǐn)?shù)挠嬎闶欠駪?yīng)該從這些角度去考慮問題。

其他，計算一定要完全吻合實驗嗎？還是應(yīng)該在我們選擇一個對該體系調(diào)研或選擇一個普遍性的方法進行計算解決一個科學(xué)問題，或是解決不了科學(xué)問題但能夠給予我們知道這些方法的缺陷然后再來迭代方法的發(fā)展？

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13樓2024-02-09 12:52:43

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wangyikeco

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【答案】應(yīng)助回帖

剛?cè)腴T計算的人大多迷信計算結(jié)果，對于灌水發(fā)文章的來說無可厚非。比如超導(dǎo)體方面的計算，若干年后這些文章就是垃圾。

而材料計算研究人員和程序開發(fā)人員更可望和搞實驗的人合作，尤其凝聚態(tài), 物理終究是實驗科學(xué)

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14樓2024-02-10 01:10:25

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14樓: Originally posted by wangyikeco at 2024-02-10 01:10:25
剛?cè)腴T計算的人大多迷信計算結(jié)果，對于灌水發(fā)文章的來說無可厚非。比如超導(dǎo)體方面的計算，若干年后這些文章就是垃圾。

而材料計算研究人員和程序開發(fā)人員更可望和搞實驗的人合作，尤其凝聚態(tài), 物理終究是實驗科學(xué)

1、實驗和理論研究其實并不割裂，理論上的進步也會反過來促進測試手段的進展。同時這意味著，測試手段的進展會導(dǎo)致現(xiàn)在一些測試手段在未來也會被淘汰，對于計算手段也是一樣，這都很正常。
2、上面沒有提到的問題是實驗本身就可能存在一些偏差，這種偏差可能來自于儀器自身，也可能是實驗條件設(shè)計不周所導(dǎo)致，也可能是材料合成過程當(dāng)中的問題，一味去湊這個結(jié)果本身就沒有意義，需要不同手段相互佐證。
3、發(fā)paper等角度說，計算和程序開發(fā)人員可能會更愿意和實驗人員合作，但也只是可能。由于第一性原理計算的特殊性，恰恰是可以寫出體系的薛定諤方程而很難精確求解（雖然實際體系有超出薛定諤方程本身的東西），從做方法和算法的角度即便不依靠實驗也有很多事情需要做，甚至可以完全是模型體系，本質(zhì)上可能會更偏計算數(shù)學(xué)。

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15樓2024-02-10 08:23:29

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【答案】應(yīng)助回帖

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15樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2024-02-09 12:23:29
1、實驗和理論研究其實并不割裂，理論上的進步也會反過來促進測試手段的進展。同時這意味著，測試手段的進展會導(dǎo)致現(xiàn)在一些測試手段在未來也會被淘汰，對于計算手段也是一樣，這都很正常。
2、上面沒有提到的問題 ...

你根本就沒有理解人家的意思。

計算不等于理論，雖然計算以理論為基礎(chǔ)。
Dirac equation是理論，你搞的各種近似是計算

薛定諤方程本身就有缺陷，才有了后來的Dirac equation（也不完美）, Bogoliubov-de Gennes equation（也不完美）
單個方程是解決不了復(fù)雜的問題
如果你定位自己是搞理論的，不妨研究方程組（like Maxwell equestions）

方法和算法離開實際應(yīng)用毫無意義，數(shù)學(xué)靠的邏輯和自�。ú魂P(guān)心有沒有用）

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16樓2024-02-10 23:47:35

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16樓: Originally posted by rlafite at 2024-02-10 23:47:35
你根本就沒有理解人家的意思。

計算不等于理論，雖然計算以理論為基礎(chǔ)。
Dirac equation是理論，你搞的各種近似是計算

薛定諤方程本身就有缺陷，才有了后來的Dirac equation（也不完美）, Bogoliubov-de Ge ...

先不要急。
1、密度泛函理論（DFT）、動態(tài)平均場理論（DMFT）等等這些明確標(biāo)注THEORY的是理論嗎？
2、既然不脫離實際，那么大部分的化學(xué)體系是否有必要上升到QED，Dirac甚至是Schrodinger方程乃至于BO近似之上？還是說目前典型體系其實通過Schrodinger方程做BO其實已經(jīng)能抓住主要矛盾？
3、在2的基礎(chǔ)上考慮方法和算法具體的復(fù)雜度之后，高精度的方法和算法來研究小型體系作為作為基礎(chǔ)，發(fā)展其他方法參考其結(jié)果，其意義如何？那么為啥要做近似，我不知道你是否深入思考過，這個其實牽扯到很多學(xué)科，否則后續(xù)爭論沒有意義。

事實上，應(yīng)該回到LZ的問題，我的觀點應(yīng)該比較明確，可以根據(jù)LZ的體系和要研究的性質(zhì)調(diào)研DFT相關(guān)的測試集，選取一個能夠平衡精度和效率的方案，而不是破罐子破摔。

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17樓2024-02-11 06:19:25

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17樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2024-02-10 10:19:25
先不要急。
1、密度泛函理論（DFT）、動態(tài)平均場理論（DMFT）等等這些明確標(biāo)注THEORY的是理論嗎？
2、既然不脫離實際，那么大部分的化學(xué)體系是否有必要上升到QED，Dirac甚至是Schrodinger方程乃至于BO近似之上？ ...

先祝龍年吉祥！
樓主的問題早解決了。你是第一性原理方面的專家，所以和你辯論其他方面的。

Hot dog is a not a dog!
“密度泛函理論（DFT）、動態(tài)平均場理論（DMFT）等等這些明確標(biāo)注THEORY”真的算不上是理論，確切說是方法和算法
就像是窮小子騙大姑娘說自己是百萬富豪

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18樓2024-02-13 00:17:48

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18樓: Originally posted by rlafite at 2024-02-13 00:17:48
先祝龍年吉祥！
樓主的問題早解決了。你是第一性原理方面的專家，所以和你辯論其他方面的。

Hot dog is a not a dog!
“密度泛函理論（DFT）、動態(tài)平均場理論（DMFT）等等這些明確標(biāo)注THEORY”真的算不上是 ...

兄臺新年同樂，龍年吉祥

！

非常歡迎討論，我認(rèn)為你說的有一定的道理。我們也許可以這樣展開，牽扯到物理層面如從Schrodinger方程到Dirac方程考慮了相對論這應(yīng)該是理論，或是從Hamilton-Jacobi過渡到Schrodinger方程的量子化也算理論。但實際上如你所說Schrodinger和Dirac方程本身可能都沒那么完美，也需要基于一些假設(shè)構(gòu)造出來的（雖然建立在大量物理事實和邏輯上）。

再來聊求解手段，包括變分解微分方程，或是通過Green函數(shù)轉(zhuǎn)換到積分方程，不同基函數(shù)的逼近方式這些可能確實不算理論，所以上面我所提到這些東西可能和計算數(shù)學(xué)以及高性能等關(guān)系非常密切。

（就這其實還是建立在BO近似上，其實還有更復(fù)雜的多體問題。）對于電子結(jié)構(gòu)的問題非常特殊的點在于，嚴(yán)格一些的數(shù)值求解手段是存在的，比如完全組態(tài)作用展開（Full CI），但其計算復(fù)雜度根本沒辦法用于實際化學(xué)體系，實用角度說人們不得不被迫做近似模型或者探索其他求解手段，這種范式下兩方面的特征應(yīng)該會都有，沒辦法割裂。如果把這些復(fù)雜的多體效應(yīng)類比于QED沒包含的效應(yīng)去構(gòu)造方程或是模型，可能這也算是理論，其實非常難說得清楚。

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19樓2024-02-13 09:52:54

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