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請教高手，微擾密度泛函方法(DFPT)計算聲子譜，phonopy得不到band.yaml文件，咋辦 已有1人參與
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VASP結(jié)合Phonopy計算聲子譜，微擾密度泛函方法(DFPT)，計算結(jié)束后運行phonopy --fc vasprun.xml得到FORCE_CONSTANTS文件，準(zhǔn)備band.conf文件， 運行phonopy --dim 2 2 2 -c POSCAR-unitcell band.conf得不到band.yaml文件。出現(xiàn)提示： "band.conf" was read as phonopy configuration file. Crystal structure was read from "POSCAR-unitcell". Unit of length: angstrom Band structure mode Settings: Force constants symmetrization: on Supercell: [2 2 2] Spacegroup: Pbcm (57) Use -v option to watch primitive cell, unit cell, and supercell structures. Force constants are read from "FORCE_CONSTANTS". Number of atoms in supercell (224) is not consistent with the matrix shape of force constants (28, 28) read from FORCE_CONSTANTS. Please carefully check DIM, FORCE_CONSTANTS, and POSCAR-unitcell. |
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- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
- 管轄: 第一性原理
2樓2024-02-11 20:55:39
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我是參照找個教程 （ force constant 文件是在計算結(jié)束后運行phonopy --fc vasprun.xml得到的 ）： 微擾密度泛函方法(DFPT) 將SPOSCAR復(fù)制為POSCAR，INCAR設(shè)置如下 Global Parameters ISTART = 0 ISPIN = 1 ICHARG = 2 LREAL = .FALSE. ENCUT = 500 PREC = A LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. ADDGRID= .TRUE. Electronic Relaxation ISMEAR = 0 SIGMA = 0.05 NELM = 90 NELMIN = 6 EDIFF = 1E-08 GGA = PE ALGO = N Ionic Relaxation NSW = 1 IBRION = 8 EDIFFG = -0.01 KPOINTS為 K-Spacing Value to Generate K-Mesh: 0.040 0 Gamma 4 4 4 0.0 0.0 0.0 計算結(jié)束后運行phonopy --fc vasprun.xml得到FORCE_CONSTANTS文件。 準(zhǔn)備band.conf文件，如下 ATOM_NAME = Si DIM = 2 2 2 BAND = 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.0, 0.5 0.5 1.0 0.0 0.0 0.0, 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.5 BAND_POINTS = 51 BAND_LABELS = $\Gamma$ X, X $\Gamma$, $\Gamma$ L BAND_CONNECTION = .TRUE. FORCE_CONSTANTS = READ FC_SYMMETRY = .TRUE. 運行phonopy --dim 2 2 2 -c POSCAR-unitcell band.conf得到band.yaml文件。 運行phonopy-bandplot --gnuplot > band.dat得到可用Origin畫圖的band.dat文件。 注意：如果想要直接出圖，可以運行phonopy -c POSCAR-unitcell band.conf -p -s，之后會得到band.pdf文件等，里邊繪制好了聲子譜。 |
3樓2024-02-21 10:37:25
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