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[交流]
離子化合物模型構(gòu)建
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想計算a分子的吉布斯自由能,構(gòu)建了模型b,c是gauss優(yōu)化后的結(jié)構(gòu),b中O和K以共價鍵形式連接了,實際O和K應(yīng)該是以離子鍵形式連接,離子鍵應(yīng)該怎么在模型體現(xiàn)出來? a.png b.png c.png |
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送紅花一朵 |
老師您好,我想問一下如果我想計算萘甲酸和氫氧化鉀反應(yīng)生成萘甲酸鉀和水這個反應(yīng)的吉布斯自由能,是否可以用高斯分別優(yōu)化這四個分子,分別得到他們的EE+thermal free energy correction,然后用萘甲酸鉀和水的EE+thermal free energy correction減去萘甲酸和氫氧化鉀的EE+thermal free energy correction。另如果反應(yīng)條件為500℃的高溫,反應(yīng)物升溫前是固體,我計算的機組為# b3lyp/6-311g(d,p) opt freq,這個設(shè)置是否還應(yīng)該做什么改變?比如是否加色散矯正?是否因為反應(yīng)物為固體而增加什么設(shè)置? |
版主 (著名寫手)
| 高斯的計算是真空中的結(jié)構(gòu) 且電荷都是趨于平均化。也就是不太可能出現(xiàn)一個分子內(nèi)有完整分離的陰陽離子對兒, 而是會算出讓電荷平均化后的分子(真空中出現(xiàn)電離的等離子態(tài)本就是很困難的)。要想規(guī)定一邊是陽離子一邊是陰離子 那需要做Constrained DFT 這個NWchem這種程序支持。 如果是固體狀態(tài)下的離子化合物,那應(yīng)該用第一性原理的那些方法去計算了 而不是用高斯這類量子化學(xué)計算軟件。 就高斯優(yōu)化出來的這個結(jié)構(gòu)是相對合理的。本來那個負電荷就是在兩個O上平均分配的幾乎。所以K應(yīng)該要基本在這兩個O中間其實沒有什么問題。 |
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