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精確轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點繪圖
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“掌握轉(zhuǎn)錄因子活動控制高等生物發(fā)育的基本原理非常有用，”紐約大學(xué)生物學(xué)系教授Stephen Small說�！案唧w地講，這項機理的發(fā)現(xiàn)為由于轉(zhuǎn)錄因子受到干擾的突變基因?qū)е屡咛グl(fā)育深層破壞和一系列疾病提供了一個潛在的治療途徑�！� 這項研究發(fā)表于《Genes & Development》，參與研究的機構(gòu)還包括哈佛醫(yī)學(xué)院和約翰霍普金斯。 數(shù)百種轉(zhuǎn)錄因子在不同個體細胞類型中按照不同組合類型表達，伴隨胚胎發(fā)育進行，還在不斷變化，這讓生物學(xué)家很難準確地理解轉(zhuǎn)錄因子如何控制胚胎發(fā)育。而且許多研究結(jié)果甚至自相矛盾。例如，生化實驗表明一個家族中與相同DNA序列相結(jié)合的TFs，在遺傳學(xué)實驗中卻被證明它們在發(fā)育胚胎細胞中的活性非常不同。 “因此，我們才應(yīng)該確定某個特定TF的結(jié)合位點和它將要激活的靶基因，”Small解釋道。 以博后學(xué)者Rhea Datta為首的科學(xué)家們研究了果蠅的兩個相似的TFs（Bicoid [Bcd]和Orthodenticle [Otd]），過去的研究顯示，它們與一段相同的DNA序列（TAATCC）結(jié)合。 研究人員直接繪制了Bcd和Otd在胚胎中的整個遺傳區(qū)域結(jié)合圖譜，結(jié)果顯示一些區(qū)域可以結(jié)合兩種蛋白，另一些區(qū)域只能結(jié)合二者之一。進一步研究發(fā)現(xiàn)，實際上兩種蛋白的結(jié)合偏好與它們的共用TAATCC序列相比僅有一個堿基之差，此外，Bcd的結(jié)合僅發(fā)生在包含另外兩種TFs結(jié)合位點的基因組區(qū)域，這兩種TFs可能有助于Bcd的結(jié)合。 至此，一個TFs與之結(jié)合、控制基因表達、決定細胞命運的精確DNA序列終于水落石出。 作者：畢合生物 公眾號：畢合生物 畢合生物(www.bihebio.com)提供服務(wù)內(nèi)容：分子生物學(xué)、免疫, 重組蛋白及ELISA相關(guān)、活性小分子化合物、高端化學(xué)、材料化學(xué)、細胞資源庫與培養(yǎng)相關(guān)、生命科學(xué)、天然產(chǎn)物 |
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