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[交流]
求助一下MS Forcite加電場的問題
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大佬們,我現(xiàn)在在做水溶液體系膜分離的分子動力學(xué)模擬,加入了電場,有以下幾個問題請求大佬們解答! 1腳本中設(shè)置的電場強(qiáng)度比現(xiàn)實實驗中的電場強(qiáng)度要大幾個數(shù)量級,是因為模擬的時間尺度太小,因此需要加大電場強(qiáng)度在有限的模擬時間內(nèi)獲得明顯離子的遷移效果嗎? 2加入電場后,軟件生成的energy.xcd文件中,體系的total energy和potential energy持續(xù)變負(fù),是正常的嗎?是因為電場持續(xù)向體系中輸入能量導(dǎo)致體系能量越來越負(fù)嗎?輸入能量不應(yīng)該越來越正嗎? 3加入電場后,分析體系中離子的MSD,相同的盒子和模擬條件但是MSD復(fù)現(xiàn)性特別差,重復(fù)十幾組計算,最大的斜率差能相差五六倍,這樣正常嗎?是體系初始化時速度的隨機(jī)賦值導(dǎo)致的嗎? 如有大佬能給予解答提供建議,感激不盡! 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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