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[求助]
想請教一下關于噬菌體的生物信息學分析的問題 已有1人參與
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1.噬菌體進化樹序列的篩選是用ncbi上blast出來的序列就可以達到建樹的目的了嗎，還是需要找其他菌屬的噬菌體序列一起構建進化樹，該怎么選擇？ 2.做噬菌體的比較基因組學，應該選擇什么樣的序列去和目的噬菌體比較呢？ 對于這方面的知識還是菜鳥，希望大家?guī)蛶兔獯饉拜托了 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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【答案】應助回帖
感謝參與，應助指數 +1
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我想回答第一個問題，但因為我不是研究基因組學的，所以不能回答第二個問題。 用你自己的噬菌體序列在NCBI中BLAST得到的結果中，大多和你自己所研究的噬菌體親緣關系較近，可能皆為同屬甚至同種；所以如果想建立系統(tǒng)發(fā)育關系，還需要進一步找到不同屬以及更高階元的噬菌體物種的同源片段序列；找序列可以參考相近研究文獻中所使用的物種序列號，這可以在文獻的樹圖或者后附的SI中找到。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2023-05-03 20:51:13
3樓2023-05-04 22:05:38
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