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Noiost鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助：ST能量計(jì)算在914.Exe階段終止，是否是內(nèi)存問(wèn)題，如何解決？ 已有1人參與
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在虛擬機(jī)Ubuntu下進(jìn)行高斯計(jì)算，虛擬機(jī)內(nèi)存為26G，Default.Route文件設(shè)置：-Mem 25GB, -P 12 分子優(yōu)化后進(jìn)行ST能量計(jì)算，設(shè)置如下： # td=(50-50,nstates=10) rb3lyp/6-31g(d,p) BBT-TPA-ST 0 1 觀察過(guò)計(jì)算過(guò)程，發(fā)現(xiàn)在914.exe階段，%mem最大達(dá)到93，然后忽然計(jì)算結(jié)束。 計(jì)算終止，log輸出文件顯示： **** Warning!!: The smallest alpha delta epsilon is 0.55306283D-01 Would need an additional 1989458600000 words for in-memory AO integral storage. Orbital symmetries: Occupied (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) …… (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) 80 initial guesses have been made. Convergence on wavefunction: 0.001000000000000 Iteration 1 Dimension 80 NMult 0 NNew 80 CISAX will form 48 AO SS matrices at one time. ①考慮到是不是內(nèi)存問(wèn)題，修改過(guò)虛擬機(jī)內(nèi)存，Default文件內(nèi)存，但計(jì)算還是終止，相同log輸出。 ②刪除Scratch文件夾下臨時(shí)文件，清理空間，計(jì)算終止，相同log輸出。 實(shí)在不知道是什么原因，該如何解決，求大佬指教！ log文件連接：鏈接: https://pan.baidu.com/s/1Qmf0VI488Vd8e46_0nQvsw?pwd=hbdg 提取碼: hbdg |
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3樓2023-03-15 11:33:59
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| 從文件看沒啥高斯的問(wèn)題。應(yīng)該是其它問(wèn)題（無(wú)論是虛擬機(jī) 內(nèi)存或者什么其它問(wèn)題）試著%mem再少給點(diǎn)兒內(nèi)存比如20GB 因?yàn)樘咏闾摂M機(jī)的上限有可能爆掉就直接彈出來(lái)了。我在我服務(wù)器上試了試 這個(gè)輸入文件 是可以算的 內(nèi)存是夠的。 |
2樓2023-03-15 10:59:50
paramecium86
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倒也未必是越多越好。高斯因?yàn)槭褂玫氖荗penMP并行對(duì)比使用mpi并行的軟件（比如ORCA）對(duì)內(nèi)存大小的需求并沒有特別的高。給16GB內(nèi)存就能應(yīng)付絕大部分日常就算尤其是DFT類的計(jì)算。分子大了可能頻率計(jì)算會(huì)對(duì)內(nèi)存有要求。但是高斯如果計(jì)算過(guò)程中發(fā)現(xiàn)內(nèi)存不太夠 會(huì)自己降低核心數(shù)目來(lái)滿足內(nèi)存。所以也不同太擔(dān)心。我個(gè)人經(jīng)驗(yàn)。如果內(nèi)存實(shí)在不充裕16GB已經(jīng)可以應(yīng)付絕大部分日常的非post-HF計(jì)算了。當(dāng)然如果有條件分配32GB 64GB也都是常見選擇。內(nèi)存給的足夠多對(duì)于td和freq計(jì)算都能有速度的提升。 |
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Noiost4樓2023-03-15 14:02:59
Noiost
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