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| 【有獎(jiǎng)交流】積極回復(fù)本帖子,參與交流,就有機(jī)會(huì)分得作者 伊里斯K 的 5 個(gè)金幣 | |||
伊里斯K新蟲 (初入文壇)
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[交流]
LAMMPS求助:reaxff/lg力場(chǎng)如何模擬金屬配合物
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各位老師好,我想要將手上的一批金屬有機(jī)配合物進(jìn)行reaxff/lg模擬,但沒(méi)有找到使用包含鐵氮的lg力場(chǎng)相關(guān)的文獻(xiàn),于是選擇將包含鐵氮的非lg力場(chǎng),按照文獻(xiàn)(10.1021/jp201599t)的方法手動(dòng)加入鐵的兩個(gè)lg參數(shù)。Fe的Re依照文獻(xiàn)選用92年的UFF中的數(shù)據(jù),Clg通過(guò)DFT計(jì)算出長(zhǎng)程能量校正后,依照文獻(xiàn)中給出的公式2.3算出。 然而我在實(shí)際進(jìn)行模擬時(shí)發(fā)現(xiàn),無(wú)論是作為試驗(yàn)用的Fe24N10晶體,還是我想要模擬的鐵氮配合物,使用lg力場(chǎng)時(shí)都會(huì)報(bào)錯(cuò):non-numeric pressure, simulation unstable。我起初認(rèn)為這是我的初始結(jié)構(gòu)不合理,但即使經(jīng)過(guò)cg/minimize后也依然會(huì)出現(xiàn)相同的錯(cuò)誤。我嘗試著手動(dòng)更改了這兩個(gè)數(shù)值,貌似無(wú)論取多大的值都是一樣的報(bào)錯(cuò)。但同樣的模型,使用非lg力場(chǎng)時(shí)卻可以正常地模擬,這是否證明我的模型本身沒(méi)有問(wèn)題呢。 請(qǐng)問(wèn)問(wèn)題是出現(xiàn)在我手動(dòng)添加的兩個(gè)數(shù)值上嗎?還是我的in文件中的指令有錯(cuò)誤? 我的測(cè)試文件如下鏈接:https://pan.baidu.com/s/13l-CTCXRvIjU-u0KmweqMQ?pwd=17zy 提取碼:17zy 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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