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[求助]
【Guassian計(jì)算求助】怎么算 四水合硝酸錳 和六水合硝酸鎳 的分子動(dòng)力學(xué)直徑
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【Guassian計(jì)算求助】 請(qǐng)問大家有人知道怎么算 四水合硝酸錳 和六水合硝酸鎳 這種東西的分子直徑嗎? 因?yàn)樽鰧?shí)驗(yàn)用到這兩種藥品,它們的熔點(diǎn)都很低,加熱就變成液態(tài)。 但是現(xiàn)在的困難是不知道熔鹽狀態(tài)下,這兩個(gè)物質(zhì)的分子動(dòng)力學(xué)直徑,也就不能判斷能不能通過過濾孔。 我想根據(jù)計(jì)算化學(xué)論壇上 大佬sobereva發(fā)的計(jì)算分子動(dòng)力學(xué)直徑的方法用高斯 wft 和VMD聯(lián)合去算一下。 但是遇到的問題是,這兩個(gè)物質(zhì)都不是有機(jī)物,是鹽的水合物。四水合硝酸錳能從劍橋CCDC數(shù)據(jù)庫找.mol2結(jié)構(gòu)文件 但是六水合硝酸鎳的找不到,只能找到cif晶胞文件自己刪掉多余的然后用diamond轉(zhuǎn)成mol文件用Guassian view識(shí)別。 我想向各位大佬求助 我上述的方法對(duì)嗎。還有關(guān)于金屬鹽水合物這種東西 用什么去算結(jié)構(gòu)優(yōu)化呢 B3LYP/def2tzvp可以嗎 |
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