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youxistar金蟲 (小有名氣)
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[交流]
GWAS 如何尋找顯著SNP 附近的功能元件(結(jié)合位點、其他遠處基因的增強子)
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chr11 failed to annotate any genes, please clarify how you annotate genes. how about the nearest genes? is there any functional element such as biding sites, or enhancers linking to other genes which are far from the gwas snp? 11號染色體上的顯著snp沒有注釋到任何基因,請說明你是如何注釋基因的最接近的基因呢? 是否存在任何功能元件,如結(jié)合位點或其他基因(與gwas 獲得的該snp距離很遠)的增強子? 大家好,請問如何回答,在設(shè)置的注釋區(qū)間范圍里(上下游100kb),沒有找到基因信息,審稿者問是否有功能元件(結(jié)合位點),或者其他遠距離基因的增強子,這個應(yīng)如何去搜索與解答呢?謝謝老師們不吝賜教 |
金蟲 (小有名氣)
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