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新蟲 (初入文壇)

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蟲號: 8010860
注冊: 2018-02-11
專業(yè): 藥物化學(xué)

[求助] 計(jì)算dppf與醋酸鈀螯合物出現(xiàn)的錯誤已有1人參與

%chk=D:/Cai/gaussian/Furan Artical/DPPF.chk
%mem=1GB
%nproc=1
-----------------------
# opt freq b3lyp/genecp
-----------------------
DPPF
----
Charge =  0 Multiplicity = 1

C
C                1             B1
C                2             B2 1             A1
C                3             B3 2             A2 1             D1
C                4             B4 3             A3 2             D2
C                4             B5 3             A4 2             D3
C                6             B6 4             A5 3             D4
C                6             B7 4             A6 3             D5
C                7             B8 6             A7 4             D6
C                9             B9 7             A8 6             D7
Fe                7          B10 6             A9 4             D8
P                1          B11 2          A10 3             D9
P                8          B12 6          A11 4          D10
C                13          B13 8          A12 6          D11
H                14          B14 13          A13 8          D12
H                14          B15 13          A14 8          D13
H                14          B16 13          A15 8          D14
C                13          B17 8          A16 6          D15
H                18          B18 13          A17 8          D16
H                18          B19 13          A18 8          D17
H                18          B20 13          A19 8          D18
C                12          B21 1          A20 2          D19
H                22          B22 12          A21 1          D20
H                22          B23 12          A22 1          D21
H                22          B24 12          A23 1          D22
C                12          B25 1          A24 2          D23
H                26          B26 12          A25 1          D24
H                26          B27 12          A26 1          D25
H                26          B28 12          A27 1          D26
H                5          B29 4          A28 3          D27
H                4          B30 3          A29 2          D28
H                3          B31 2          A30 1          D29
H                2          B32 1          A31 5          D30
H                6          B33 4          A32 3          D31
H                7          B34 6          A33 4          D32
H                9          B35 7          A34 6          D33
H                10          B36 9          A35 7          D34
Pd             12          B37 1          A36 2          D35
O                38          B38 12          A37 1          D36
O                38          B39 12          A38 1          D37
C                39          B40 38          A39 12          D38
C                40          B41 38          A40 12          D39
C                41          B42 39          A41 38          D40
H                43          B43 41          A42 39          D41
H                43          B44 41          A43 39          D42
H                43          B45 41          A44 39          D43
O                42          B46 40          A45 38          D44
O                41          B47 39          A46 38          D45
C                42          B48 40          A47 38          D46
H                49          B49 42          A48 40          D47
H                49          B50 42          A49 40          D48
H                49          B51 42          A50 40          D49

B1          1.43230679
B2          1.42649081
B3          1.42721436
B4          1.42330418
B5          3.38536316
B6          1.42705724
B7          1.43001423
B8          1.42743915
B9          1.42330399
B10          2.04809586
B11          1.85517168
B12          1.86122731
B13          1.88139048
B14          1.09286830
B15          1.09305315
B16          1.09026591
B17          1.87444279
B18          1.09341185
B19          1.09279449
B20          1.08972007
B21          1.87803768
B22          1.09243613
B23          1.09284900
B24          1.09072635
B25          1.87074984
B26          1.09286574
B27          1.09227309
B28          1.09089957
B29          1.08189615
B30          1.08175273
B31          1.08192904
B32          1.08106989
B33          1.08088975
B34          1.08197687
B35          1.08185792
B36          1.08084632
B37          2.41412881
B38          2.04569032
B39          2.04070751
B40          1.32358640
B41          1.30021377
B42          1.52420290
B43          1.09545640
B44          1.09615124
B45          1.09111348
B46          1.23610259
B47          1.22324742
B48          1.54000000
B49          1.07000000
B50          1.07000000
B51          1.07000000
A1          107.93464996
A2          108.07910200
A3          108.27772866
A4          96.88923334
A5          73.50721553
A6          101.90758681
A7          108.07319201
A8          108.22539242
A9          70.50485124
A10       127.86543388
A11       127.48266229
A12       102.23658022
A13       108.99332796
A14       110.01583761
A15       109.23427332
A16       104.83392573
A17       110.11842723
A18       108.33287249
A19       108.24570776
A20       103.87949919
A21       108.90739918
A22       110.72697764
A23       108.42769990
A24       104.74469695
A25       111.06483745
A26       108.64859267
A27       107.80236138
A28       126.19910970
A29       126.11831620
A30       125.63043214
A31       126.17289200
A32          93.70520364
A33       125.64153600
A34       126.04403281
A35       127.20039403
A36       100.12534402
A37          85.69839856
A38          94.00014568
A39       122.40786505
A40       124.73856505
A41       117.29882715
A42       110.67116679
A43       110.31649569
A44       109.77185985
A45       126.11555561
A46       120.79578347
A47       112.98576339
A48       109.47120255
A49       109.47120255
A50       109.47123134
D1          -0.88003943
D2          -0.47712238
D3          -82.30112311
D4          -38.85474224
D5          66.61109498
D6          96.50343117
D7          -0.42609171
D8          36.38106170
D9       -174.37058394
D10       110.51623768
D11       122.09191506
D12       -175.45299151
D13       -55.25830246
D14          65.21882125
D15          14.61359196
D16          51.09861909
D17       170.76597207
D18       -70.91378618
D19       113.79873594
D20       -173.51400873
D21       -52.35401261
D22          68.24447761
D23          3.53219715
D24          50.47345664
D25       170.98911195
D26       -71.18185036
D27       -175.18474081
D28       -178.21090972
D29       -179.55321778
D30       -178.51968174
D31       -165.46392866
D32       -82.25998774
D33       -178.52045124
D34       -177.35889048
D35       -118.50003493
D36          88.74220318
D37       -98.24763476
D38       122.39121975
D39          94.51283913
D40          -9.70977572
D41       -57.29622729
D42          61.02488519
D43       -178.38214701
D44          -6.04372263
D45       170.18396877
D46       175.65719144
D47       179.97662509
D48       -60.02336012
D49          59.97663248

p pd 0
lanl2dz
****
c fe o h 0
6-31g(d,p)
****

p pd 0
lanl2dz

最后正常結(jié)束了，但是中間提醒了P沒有d函數(shù)，我是根據(jù)文獻(xiàn)選擇的 lanl2dz基組，文獻(xiàn)用的是dppb與鈀催化劑螯合
Warning!  P  atom 12 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  P  atom 13 may be hypervalent but has no d functions.
最后結(jié)構(gòu)優(yōu)化完顯示全部收斂
      Item             Value    Threshold  Converged?
Maximum Force          0.000205    0.000450    YES
RMS    Force          0.000037    0.000300    YES
Maximum Displacement    0.000727    0.001800    YES
RMS    Displacement    0.000119    0.001200    YES
但是優(yōu)化頻率的時候最后兩項(xiàng)沒有收斂，而且有一個虛頻。但是是正常結(jié)束的。
Item             Value    Threshold  Converged?
Maximum Force          0.000205    0.000450    YES
RMS    Force          0.000037    0.000300    YES
Maximum Displacement    0.142125    0.001800    NO
RMS    Displacement    0.017414    0.001200    NO
想請教一下這種情況要怎么處理？

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1樓 2022-06-17 15:29:36

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paramecium86

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1. opt收斂 freq又顯示不收斂的原因是opt算的時候沒有用精確的hessian矩陣導(dǎo)致算出來的梯度略有區(qū)別�？梢栽谀壳暗慕Y(jié)構(gòu)下加 opt=calcall 并且可以適當(dāng)提高積分精度，加上int=superfine 然后再次做一次優(yōu)化。

2. 那個提示是說 p的基組太小了沒有d極化。這是因?yàn)?對p這種第三行的元素用lanl2dz也太差了。應(yīng)該吧p也用6-31g(d,p) 。而且你對fe這個更重的元素都用的6-31g(d,p) 反而對p用更小的lanl2dz贗勢基組是不符合常理的。

3. lanl2dz 本身在現(xiàn)在來看就太差了。對于pd可以使用sdd 替換掉lanl2dz

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2樓2022-06-17 18:02:23

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