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Quanma@ZJU新蟲 (初入文壇)
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[交流]
關(guān)于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)TSS的定義
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網(wǎng)上查到的大部分定義為:轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)是指與新生RNA鏈第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)DNA鏈上的堿基,通常為一個(gè)嘌呤(A或G) 也有說是:轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)是指與新生RNA鏈第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)DNA模板鏈上的堿基 這里就出現(xiàn)了一個(gè)歧義,DNA有兩條鏈,一條模板鏈(反義鏈,與RNA互補(bǔ)配對(duì)),一條編碼鏈(正義鏈,與RNA序列相同),那么轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)指的是哪條鏈上與新生RNA對(duì)應(yīng)的堿基? 根據(jù)我平時(shí)讀的文獻(xiàn),新生RNA的5' end通常是一個(gè)G或者一個(gè)A,那么就意味著模板鏈對(duì)應(yīng)的那個(gè)堿基是一個(gè)C或一個(gè)T,那么事實(shí)上,轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)說的是DNA編碼鏈上對(duì)應(yīng)的那個(gè)堿基,而不是模板鏈上對(duì)應(yīng)的堿基 也就是說第一種說法未明確的DNA鏈?zhǔn)聦?shí)上是編碼鏈,而第二種說法是錯(cuò)誤的 有的文獻(xiàn)會(huì)把啟動(dòng)子TATA box和TSS畫在一起,據(jù)我所知TSS應(yīng)該是在模板鏈上?那么這時(shí)候TSS又在模板鏈上了(我個(gè)人認(rèn)為這種畫法有問題) 不知道大家怎么看待這個(gè)問題? |
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