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atomrq銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
LAMMPS vs. Hoomd/Galamost GPU版本效率測(cè)評(píng)的問題 已有6人參與
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LAMMPS GPU效率測(cè)評(píng)問題 個(gè)人對(duì)hoomd和galamost比較熟，最近用到lammps的一個(gè)模塊，因此編譯了lammps。 服務(wù)器搭載2080Ti顯卡，編譯了kokkos/cuda，lammps為github下載的最新版本。 測(cè)試體系為49000 LJ粒子，0.91的密度，rcut=2.5，fene bond標(biāo)準(zhǔn)參數(shù)，nvt系綜，T=1.0，dt=0.001，TPS (time per second) =1200。 程序運(yùn)行占用一個(gè)MPI進(jìn)程和一個(gè)OMP線程，加一塊GPU，運(yùn)行時(shí)GPU占用率82%，看起來一切正常。 然而，同一個(gè)機(jī)器上，用hoomd和galamost測(cè)試發(fā)現(xiàn)TPS至少5000，galamost調(diào)整一些細(xì)節(jié)參數(shù)，TPS可接近6000。對(duì)比之下，lammps gpu version 只有前者的20%的效率。 有沒有熟悉lammps gpu編譯，做過測(cè)評(píng)的�，F(xiàn)在我是找來找去，沒發(fā)現(xiàn)問題出在哪兒。 謝謝！ |
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匿名
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4樓2022-05-19 21:48:32
jluchemlib
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2樓2022-04-11 22:57:06
atomrq
銀蟲 (小有名氣)
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3樓2022-04-12 19:37:40
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5樓2022-07-06 16:44:51
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