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蛋白尺寸,以這種格式*nm×*nm×*nm
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各位大佬,請問如何獲得可靠的蛋白尺寸,以這種格式*nm×*nm×*nm 比如文獻里表述: Only one molecule of GOx (6.0 × 5.2 × 7.7 nm) can fit in the largest cage (6.2 nm) of PCN-888, while HRP (4.0 ×4.4×6.8 nm) can be accommodated in both the medium (5.0 nm) and large cages. 在PDB數(shù)據(jù)庫得到的GOx的信息(1gpe)里好像沒有這樣的盒子信息,有一個UNIT cell坐標(biāo), a = 57.6 α = 90 b = 132.1 β = 90 c = 151.3 γ = 90,但是和這個尺寸不匹配呀 請問可以用什么軟件做這個尺寸,因為要比較精確,目前實難室有DS軟件,也有PYMOL,請大佬賜教! |
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