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Mi_春春新蟲 (初入文壇)
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[求助]
chip-seq求助貼 已有1人參與
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有沒(méi)有老師做轉(zhuǎn)錄因子chip-seq遇到不夠建庫(kù)質(zhì)量的問(wèn)題，如何解決的呢？ @biostar2009 @wizardfan 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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農(nóng)學(xué)0402
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2樓2022-02-21 08:33:22
atikou
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【答案】應(yīng)助回帖
| 一般做CHIP-seq的時(shí)候，最后富集下來(lái)的IP濃度較低，造成的原因有一：樣本投入量比較低，導(dǎo)致被富集的下了的DNA比較少。第二：抗體量不夠。第三，做的是轉(zhuǎn)錄因子，因?yàn)檗D(zhuǎn)錄因子區(qū)域本身就比較少，所以相對(duì)的能被富集下來(lái)的IP樣本也比較少。如果對(duì)于低濃度的IP樣本建庫(kù)把握較低的或者對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果有疑問(wèn)，可以選擇深圳易基因，他們有多年做CHIP-seq的經(jīng)驗(yàn)，同時(shí)能實(shí)現(xiàn)對(duì)低濃度樣本建庫(kù)。 |
3樓2022-03-25 20:04:57
諸葛麻將
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4樓2022-07-13 13:01:48
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