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wangyikeco木蟲 (正式寫手)
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VASP6.3.0 release, 才是真實的完全版本 已有1人參與
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之前版本的VASP6只能說是閹割版本。VASP6.3.0才是真實的完全版本。 January 20, 2022 NEW RELEASE: VASP.6.3.0 A new release of VASP is available for download now! Go to the VASP Portal to get VASP.6.3.0. This requires a VASP.6 license issued by the VASP Software GmbH. 01 on-the-fly機(jī)器學(xué)習(xí)力場 可以做機(jī)器學(xué)習(xí)力場的程序已經(jīng)越來越多了,比如DeepMD-Kit,GAP-SOAP,KRR系列等。但是VASP支持的機(jī)器學(xué)習(xí)力場是on-the-fly的。原理上講比前述的方法都要先進(jìn),實測效果需要進(jìn)一步測試。 運用貝葉斯線性回歸法在分子動力學(xué)模擬過程中即時擬合力場參數(shù),On-the-fly machine learning force field generation using Bayesian linear regression,所謂的On-the-fly就是 ’實時‘ 的意思。 傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)都是先搞一些訓(xùn)練集/測試集反復(fù)的把參數(shù)訓(xùn)練好,然后再去應(yīng)用到類似的體系,這樣實際的應(yīng)用價值比較低,因為訓(xùn)練這一步就消耗了大量資源和時間,等一個體系都訓(xùn)練好了,其實所用的訓(xùn)練集已經(jīng)足夠把該體系研究清楚了。而On-the-fly的好處就是只需要很少的初始進(jìn)行訓(xùn)練,在跑AIMD的過程中,程序就不斷的拿到一些可以用作訓(xùn)練的數(shù)據(jù),然后在一邊跑AIMD的過程中就一邊訓(xùn)練力場參數(shù),當(dāng)程序認(rèn)為力場參數(shù)已經(jīng)訓(xùn)練的足夠精確了,就不用再做第一性原理的計算,直接用力場跑MD,跑一段時間之后,體系的幾何結(jié)構(gòu)又發(fā)生了明顯的變化,原來訓(xùn)練好的力場不再精確了,就要切換回AIMD,繼續(xù)產(chǎn)出訓(xùn)練集進(jìn)行訓(xùn)練。所以就在AIMD和經(jīng)典MD之間來回的切換中,仍可以達(dá)到純AIMD的計算效果和精度,在研究材料相變,晶體熔化等復(fù)雜過程中取得了巨大的成功?梢詫IMD的運算時長提升幾十倍甚至上百倍。 具體的理論和實踐需要進(jìn)一步測試再和大家分享: https://www.vasp.at/wiki/index.p ... force_field:_Theory https://www.vasp.at/wiki/index.p ... alculations:_Basics 02 完全支持OpenACC的GPU編譯 VASP6之前的版本雖然也是支持GPU,但是缺少OpenACC加持,只用CUDA編譯,其計算速度是遠(yuǎn)低于CPU的。但是最新用OpenACC編譯的vasp在計算HSE等方面已經(jīng)大大提升。具體效果需要進(jìn)一步測試。 03 支持KPOINT_OPT文件 因為能帶計算的時候一般需要k-mesh方法先SCF自洽計算,然后再用k-path非自洽計算,分兩步。最近的VASP6.3.0支持同時在KPOINT和KPOINT_OPT里分別寫入k-mesh和k-path從而一步得到能帶信息。(之后VASPKIT考慮支持KPOINTS_OPT) 04 支持AMD ZEN3 由于之前的vasp版本沒法支持AMD ZEN3架構(gòu),筆者在7t83 epyc3代上測試vasp6.2.1速度非常垃圾,不及7742的一半。新版本已經(jīng)可以支持ZEN3架構(gòu)了。 05 其他升級 支持世界第一超算Fujitsu的ARM架構(gòu)部署 支持HDF5, 支持GNU10, GNU11 支持Wannier的SCDM 提升FFTW和ELPA效率 |
木蟲 (正式寫手)
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鐵蟲 (初入文壇)
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